RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa13.69□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYBRD1Q53TN4 286 aa13.69□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALG10BQ5I7T1 473 aa13.69□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MCEMP1Q8IX19 187 aa13.69□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR6T1Q8NGN1 323 aa13.69□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MCHR1Q99705 422 aa13.69□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SRXN1Q9BYN0 137 aa13.69□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1orf21Q9H246 121 aa13.69□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa13.69□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PACSIN3Q9UKS6 424 aa13.69□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PNR3 127 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 B2RBV5 119 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 M0R3H8 397 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPIPB7O75200 414 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLGP00747 810 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BMP5P22003 454 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CPOXP36551 454 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PEX19P40855 299 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDK3Q15120 406 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ELOA3BQ3SY89 546 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CBLL1Q75N03 491 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FCRLAQ7L513 359 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM214BQ7L5A3 538 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LIX1LQ8IVB5 337 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEFB107AQ8IZN7 70 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GCNT2Q8N0V5 402 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ELOA3Q8NG57 546 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC38A4Q969I6 547 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARL5BQ96KC2 179 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDRT15Q96T59 188 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 JKAMPQ9P055 326 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLHL9Q9P2J3 617 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD300AQ9UGN4 299 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPS6KA6Q9UK32 745 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SH3GLB1Q9Y371 365 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EMC9Q9Y3B6 208 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FASNP49327 2511 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A087WUJ7 227 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A1L4Q6 167 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM90A27PA6NNH2 459 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRSS44E7EML9 344 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TPST2O60704 377 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYTIPO60759 359 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNFSF13O75888 250 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRKD3O94806 890 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPIP06744 558 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 T-ENOLP0DO92 83 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCNA2P20248 432 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IDUAP35475 653 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCYT1AP49585 367 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ASCL1P50553 236 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC35A1P78382 337 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TFF3Q07654 80 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FOXF2Q12947 444 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDSNQ15517 529 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP4R4Q6NUP7 873 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CARM1Q86X55 608 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR6K3Q8NGY3 331 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR6S1Q8NH40 331 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MPP4Q96JB8 637 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAPBPLQ9BX59 468 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR11A1Q9GZK7 315 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GORASP2Q9H8Y8 452 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NBASA2RRP1 2371 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAPPC13A5PLN9 417 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MSTNO14793 375 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHP2O43745 196 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2T1O43869 369 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FZD7O75084 574 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AHSA1O95433 338 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 THRBP10828 461 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD8BP10966 210 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFNA8P32881 189 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDH12P55289 794 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTBP2P56545 445 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H3F3AP84243 136 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BNIP2Q12982 314 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPTX1Q15818 432 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ENTPD8Q5MY95 495 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1orf140Q5VVS0 124 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GLYATQ6IB77 296 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PAQR6Q6TCH4 344 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLXDC2Q6UX71 529 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MFSD8Q8NHS3 518 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIGXQ8TBF5 258 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM162AQ96A26 154 aa13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms