RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 POGLUT1Q8NBL1 392 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 OSTF1Q92882 214 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 PCED1BQ96HM7 432 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 SYNPO2LQ9H987 977 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 IL17BQ9UHF5 180 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 HS3ST4Q9Y661 456 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 A0A1W2PPE2 198 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 A0A1W2PRQ8 180 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 C1orf226A1L170 272 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 CPED1A4D0V7 1026 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 NAP1L6A6NFF2 107 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 PSMD9O00233 223 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 MOSPD3O75425 235 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 NDUFB6O95139 128 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 FABP4P15090 132 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 LPOP22079 712 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 PSMA3P25788 255 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 RPIAP49247 311 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 NHLH2Q02577 135 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 PCGF3Q3KNV8 242 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 OLFML2AQ68BL7 652 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 FAM151BQ6UXP7 276 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 NRROSQ86YC3 692 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 SP8Q8IXZ3 490 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 THEM5Q8N1Q8 247 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 SIRT6Q8N6T7 355 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 STEAP2Q8NFT2 490 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 CD99L2Q8TCZ2 262 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 GPR61Q9BZJ8 451 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 TRIM36Q9NQ86 728 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 GULP1Q9UBP9 304 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF337Q9Y3M9 751 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ANK1P16157 1881 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 A0A0G2JK05 382 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 PRSS47A8MTI9 375 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 GNSP15586 552 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 CRABP1P29762 137 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 GPR15P49685 360 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 AWAT1Q58HT5 328 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 DACT2Q5SW24 774 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ARHGAP40Q5TG30 622 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 GPC2Q8N158 579 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 LRRC18Q8N456 261 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 C17orf47Q8NEP4 570 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 OR8J2Q8NGG1 315 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 POC1BQ8TC44 478 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 RFKQ969G6 155 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 SPATA33Q96N06 139 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ASB16Q96NS5 453 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 MICU1Q9BPX6 476 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 P2RY12Q9H244 342 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 RGCCQ9H4X1 137 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 VPS29Q9UBQ0 182 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 OARD1Q9Y530 152 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 MMP24Q9Y5R2 645 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 A0A0C4DFX4 3053 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 IL5P05113 134 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 SBK2P0C263 348 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 NTSP30990 170 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 PYCR1P32322 319 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 MNDAP41218 407 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF84P51523 738 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 RING1Q06587 406 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 CBFBQ13951 182 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 DOC2AQ14183 400 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 MEF2DQ14814 521 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF385BQ569K4 471 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 ANXA8L1Q5VT79 327 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 PARGQ86W56 976 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM99Q8N816 258 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 OR7G2Q8NG99 324 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 CHST5Q9GZS9 411 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 SLC32A1Q9H598 525 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD1-203ENST00000395211 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms