RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 CDH11P55287 796 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 PSPHP78330 225 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SYPL1Q16563 259 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ZSWIM7Q19AV6 140 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC36Q1X8D7 754 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SLC36A2Q495M3 483 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 DNAL1Q4LDG9 190 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 MFSD12Q6NUT3 480 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 C6orf89Q6UWU4 347 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZS92 163 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OSBPL10Q9BXB5 764 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ACTR6Q9GZN1 396 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TUBB1Q9H4B7 451 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 PRORYQ9H606 182 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF225Q9UK10 706 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 F8P00451 2351 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 FRG2CA6NGY1 282 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF814B7Z6K7 855 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 MT-ND1P03886 318 aa4.03□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 FUT1P19526 365 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ASCL1P50553 236 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 LIPEQ05469 1076 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 FOXF1Q12946 379 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 BLMHQ13867 455 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SYT14P1Q58G82 188 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OR7E24Q6IFN5 339 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF793Q6ZN11 406 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 GRINAQ7Z429 371 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CARM1Q86X55 608 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 FAM86B1Q8N7N1 296 aa4.03□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 OR5L1Q8NGL2 311 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OR4C15Q8NGM1 316 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ZFP90Q8TF47 636 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 MAL2Q969L2 176 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CGREF1Q99674 301 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 RIBC2Q9H4K1 309 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ZIM2Q9NZV7 527 aa4.03□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 A0A0G2JPF8 293 aa4.03□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 PLA2G2AP14555 144 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 DRD5P21918 477 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 HBA1P69905 142 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CAMK2BQ13554 666 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 PPA1Q15181 289 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 MPEG1Q2M385 716 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD16Q6P6B7 361 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 KRT77Q7Z794 578 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SLC30A8Q8IWU4 369 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 GALNT4Q8N4A0 578 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CYGBQ8WWM9 190 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 PGAM5Q96HS1 289 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 TUBA1CQ9BQE3 449 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 IL1RAPQ9NPH3 570 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 CMAHPQ9Y471 501 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 LIPGQ9Y5X9 500 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 A0A087WZY1 265 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OR6C70A6NIJ9 312 aa4.03□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 PDE5AO76074 875 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 NTN1O95631 604 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 LDLRP01130 860 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 IGHG1P01857 330 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 BSGP35613 385 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 GABRA2P47869 451 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 HTR5AP47898 357 aa4.03□□□□□ -1.76
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