RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 EFCAB7A8K855 629 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 LRRN3E7EW58 273 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 NDUFB2O95178 105 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 FNTBP49356 437 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 GPR143P51810 404 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 RACK1P63244 317 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 P2RY14Q15391 338 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 FAAH2Q6GMR7 532 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 NOXA1Q86UR1 476 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 NR2C2APQ86WQ0 139 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 SLC43A2Q8N370 569 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF615Q8N8J6 731 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 SLC2A12Q8TD20 617 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 TTYH2Q9BSA4 534 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 LRRN3Q9H3W5 708 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 SLA2Q9H6Q3 261 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 CHRNA9Q9UGM1 479 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 MAU2Q9Y6X3 613 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 VCANP13611 3396 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 SPAG17Q6Q759 2223 aa16.17■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 A0A087WUJ7 227 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 A6NL46 340 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 PLA2G10O15496 165 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 PLPP2O43688 288 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 IDNKQ5T6J7 187 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 TRIQKQ629K1 86 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 RPTNQ6XPR3 784 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 C17orf47Q8NEP4 570 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 TMEM246Q9BRR3 403 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 PDE7BQ9NP56 450 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 CEP192Q8TEP8 1941 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 FAM25AB3EWG3 89 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 FAM25CB3EWG5 89 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 FAM25GB3EWG6 89 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 MCIDASD6RGH6 385 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 AGRPO00253 132 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 SDC3O75056 442 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 SHC1P29353 583 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 TAS2R43P59537 309 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 ACTC1P68032 377 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 ACTA1P68133 377 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 POU4F2Q12837 409 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 FAM27D1Q5T7N8 215 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 NKAIN2Q5VXU1 208 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 SSX6Q7RTT6 188 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 C19orf18Q8NEA5 215 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 CLIP3Q96DZ5 547 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 RNF170Q96K19 258 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 LMF1Q96S06 567 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 TTTY10Q9BZA0 68 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 CLPSP04118 112 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 CD53P19397 219 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 HLA-DMAP28067 261 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 CD1CP29017 333 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 PYCR1P32322 319 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 RPL4P36578 427 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 ACVR1BP36896 505 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 HCCSP53701 268 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 CEACAM19Q7Z692 300 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 GATSQ8NAP1 163 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 CADM4Q8NFZ8 388 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 OR51L1Q8NGJ5 315 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 OR5J2Q8NH18 312 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 ABHD4Q8TB40 342 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 UBASH3BQ8TF42 649 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 ACOT12Q8WYK0 555 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 PRODH2Q9UF12 536 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 ADAM30Q9UKF2 790 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 TLCD2A6NGC4 264 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 C17orf105B2RV13 164 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 SLC19A2O60779 497 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 HLA-DQB1P01920 261 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 MAP2K3P46734 347 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 SERTAD2Q14140 314 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 TRAM1Q15629 374 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 TCTE1Q5JU00 501 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 MZT2BQ6NZ67 158 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 MED25Q71SY5 747 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 RFLNBQ8N5W9 214 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 UCKL1Q9NWZ5 548 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 ICAM5Q9UMF0 924 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS1-202ENST00000323081 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms