RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR4P46093 362 aa24.81■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-201ENST00000318988 COX10Q12887 443 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 SELENBP1Q13228 472 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 HYAL4Q2M3T9 481 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASB18Q6ZVZ8 466 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM251Q8N6I4 163 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC39A7Q92504 469 aa24.81■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa24.81■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-201ENST00000318988 Q6ZS92 163 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 SFXN2Q96NB2 322 aa24.8■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2M5A3KFT3 312 aa24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 EFCAB9A8MZ26 197 aa24.79■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM44Q2T9K0 475 aa24.79■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa24.79■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-201ENST00000318988 K7EM74 188 aa24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 MITFO75030 526 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC10A1Q14973 349 aa24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf140Q5VVS0 124 aa24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM109AQ8N4B1 249 aa24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 RIBC2Q9H4K1 309 aa24.78■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-201ENST00000318988 H3BML4 177 aa24.77■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CH25HO95992 272 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM87AP0C7U9 286 aa24.77■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KLHL17Q6TDP4 642 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD300LDQ6UXZ3 194 aa24.77■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF24P17028 368 aa24.76■■□□□ 1.55
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CTDNEP1-201ENST00000318988 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 H3BN98 237 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLF4O43474 513 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPIPB7O75200 414 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 HIST1H2ABP04908 130 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 FUT1P19526 365 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 SFTPDP35247 375 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUP107P57740 925 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAC1P63000 192 aa24.75■■□□□ 1.55
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