RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 B4DGG1 531 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ARPC3O15145 178 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 CT45A8P0DMV1 189 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 CT45A9P0DMV2 189 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ACVR1BP36896 505 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 HSD17B7P56937 341 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 CT45A2Q5DJT8 189 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 OR4M1Q8NGD0 313 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 OR4K13Q8NH42 304 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 SMIM19Q96E16 107 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ARSGQ96EG1 525 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 MSANTD3Q96H12 275 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 UCK1Q9HA47 277 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 A0A0G2JK05 382 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1W2PPC4 97 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 GATBO75879 557 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 IGF2P01344 180 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 CTSBP07858 339 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 RCVRNP35243 200 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 PRPS1P60891 318 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 CDONQ4KMG0 1287 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC58Q4VC31 144 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 LIX1LQ8IVB5 337 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 BCORP1Q8N888 145 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 SDR9C7Q8NEX9 313 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 OR14A16Q8NHC5 309 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 PHYHIPQ92561 330 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 RNF170Q96K19 258 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 OR10A5Q9H207 317 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ABRACLQ9P1F3 81 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 DTX4Q9Y2E6 619 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ALG5Q9Y673 324 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 HRKO00198 91 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 RPL4P36578 427 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 DIO1P49895 249 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 RAB25P57735 213 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 BTG1P62324 171 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 HSF2Q03933 536 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 SERTAD2Q14140 314 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 CDK5R1Q15078 307 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 FAM27D1Q5T7N8 215 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 SLC35F2Q8IXU6 374 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 C16orf52Q8NHV5 167 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 GDF15Q99988 308 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 WACQ9BTA9 647 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 KLHL1Q9NR64 748 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 NOTOA8MTQ0 251 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 FASLGP48023 281 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 SIRPAP78324 504 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 IL10RAQ13651 578 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 RPTNQ6XPR3 784 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 SSX6Q7RTT6 188 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 SMRP1Q8NCR6 262 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 SNX33Q8WV41 574 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 THAP4Q8WY91 577 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF285Q96NJ3 590 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 LRRC61Q9BV99 259 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 GPR174Q9BXC1 333 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 ING3Q9NXR8 418 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 ERVK-19Q9WJR5 959 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD61A6NGH8 418 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 MCIDASD6RGH6 385 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 OR7A10O76100 309 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 TFP02787 698 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 ERP29P30040 261 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 SLC6A1P30531 599 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 LTBRP36941 435 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 CAPZBP47756 277 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 GDI2P50395 445 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 OR10A3P58181 314 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 CD83Q01151 205 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 FRMD1Q8N878 549 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 UPRTQ96BW1 309 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 PELI1Q96FA3 418 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 SLA2Q9H6Q3 261 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 NRIP3Q9NQ35 241 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 LRIT1Q9P2V4 623 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 PLCL2Q9UPR0 1127 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 CLDN16Q9Y5I7 305 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 FZD7O75084 574 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 PNMTP11086 282 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 ADH7P40394 386 aa17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms