RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COL4A3Q01955 1670 aa20.96■□□□□ 0.95
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MYO10Q9HD67 2058 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A0D9SG52 128 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RAB40ALP0C0E4 278 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IL9P15248 144 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HAAOP46952 286 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STARP49675 285 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SORDQ00796 357 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CBFBQ13951 182 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SWI5Q1ZZU3 235 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RAB40AQ8WXH6 277 aa20.95■□□□□ 0.94
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GFI1Q99684 422 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CD1AP06126 327 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FABP1P07148 127 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SRMP19623 302 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ACHEP22303 614 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC2A5P22732 501 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TP53I3Q53FA7 332 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM150AQ86TG1 271 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AMER3Q8N944 861 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC25A28Q96A46 364 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EDARQ9UNE0 448 aa20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FOSL1P15407 271 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PTNP21246 168 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ITGB8P26012 769 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PTGER1P34995 402 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAUP35544 74 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TNFRSF17Q02223 184 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 Q6ZVU0 165 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UBE3DQ7Z6J8 389 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC25A13Q9UJS0 675 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TINAGQ9UJW2 476 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DENND4CQ5VZ89 1909 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR6C74A6NCV1 312 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RCBTB2O95199 551 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMIM6P0DI80 62 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FNTBP49356 437 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GATMP50440 423 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 POU4F2Q12837 409 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CBLN2Q8IUK8 224 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR6S1Q8NH40 331 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SYNPRQ8TBG9 265 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PEX11GQ96HA9 241 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LMLNQ96KR4 655 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MS4A4EQ96PG1 132 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MRI1Q9BV20 369 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.93■□□□□ 0.94
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPP1P10451 314 aa20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FUT1P19526 365 aa20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SIRPAP78324 504 aa20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GUCA2BQ16661 112 aa20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR14A16Q8NHC5 309 aa20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PELI1Q96FA3 418 aa20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PHYHIPLQ96FC7 376 aa20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CASD1Q96PB1 797 aa20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM117AQ9C073 453 aa20.93■□□□□ 0.94
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 YIPF1Q9Y548 306 aa20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A0A6YYD5 115 aa20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RIIAD1A6NNX1 92 aa20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAN2B1O00754 1011 aa20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KCNJ3P48549 501 aa20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MANEAQ5SRI9 462 aa20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C10orf91Q5T1B1 145 aa20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR4C11Q6IEV9 310 aa20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SYS1Q8N2H4 156 aa20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NOX4Q9NPH5 578 aa20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRAV20A0A0B4J274 112 aa20.92■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRAPPC13A5PLN9 417 aa20.92■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GALTP07902 379 aa20.92■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLUP10909 449 aa20.92■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAKP20794 623 aa20.92■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AGTR1P30556 359 aa20.92■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPIAP62937 165 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AGERQ15109 404 aa20.92■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NDUFAF6Q330K2 333 aa20.92■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPAG16Q8N0X2 631 aa20.92■□□□□ 0.94
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