RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 DCTDP32321 178 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 TPBGQ13641 420 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 TMEM31Q5JXX7 168 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 TSSK4Q6SA08 328 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 AMER3Q8N944 861 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ACBD4Q8NC06 268 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 TSSK2Q96PF2 358 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 TNFSF12O43508 249 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ZNF254O75437 659 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 F11P03951 625 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 LIMS3P0CW19 117 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 LIMS4P0CW20 117 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 RGS19P49795 217 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 METAP1P53582 386 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 FGL1Q08830 312 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 CD276Q5ZPR3 534 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 OR7E24Q6IFN5 339 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 IDO2Q6ZQW0 420 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 MOAP1Q96BY2 351 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 LRIG1Q96JA1 1093 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ABHD1Q96SE0 405 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 PTDSS2Q9BVG9 487 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 HCAR1Q9BXC0 346 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ACTR10Q9NZ32 417 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 SIGLEC5O15389 551 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 SOD1P00441 154 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 RAE1P78406 368 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 SIGLEC14Q08ET2 396 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 RAB11BQ15907 218 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 DPY19L4Q7Z388 723 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 PLA2G15Q8NCC3 412 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 OR10R2Q8NGX6 335 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ELP4Q96EB1 424 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 MS4A4EQ96PG1 132 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 ACKR4Q9NPB9 350 aa14.59□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.58□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 PCNTO95613 3336 aa14.58□□□□□ -0.07
USP43-201ENST00000285199 CDC14CA4D256 554 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 SELENOFO60613 162 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 PRAMEF2O60811 474 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 LALBAP00709 142 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ATP1B1P05026 303 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 UGT2B7P16662 529 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 AGERQ15109 404 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 BCL2A1Q16548 175 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 TMEM35AQ53FP2 167 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 DCST2Q5T1A1 773 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ZNF585AQ6P3V2 769 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 TMIEQ8NEW7 156 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 LRRC46Q96FV0 321 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 SLC6A5Q9Y345 797 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 A0A0B4J2A0 478 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 SGK494L7N484 410 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 CHP2O43745 196 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 HTR3BO95264 441 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 CPMP14384 443 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 IL13RA1P78552 427 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 DEFB103AP81534 67 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 RHOUQ7L0Q8 258 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 NUP54Q7Z3B4 507 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 SIRT6Q8N6T7 355 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 TMEM168Q9H0V1 697 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 CWH43Q9H720 699 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 RPS10P5Q9NQ39 176 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ABRACLQ9P1F3 81 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 RGS13O14921 159 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 PRAF2O60831 178 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 PPM1BO75688 479 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 LGI1O95970 557 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 FOSL2P15408 326 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ZNF28P17035 718 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 MFSD8Q8NHS3 518 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 NR4A3Q92570 626 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 TAPBPLQ9BX59 468 aa14.58□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 A0A0A6YYH2 397 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 FITM1A5D6W6 292 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 A6NJ64 397 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 FFAR1O14842 300 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms