RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plet1Q8VEN2 237 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr108Q8VFA1 320 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam166aQ9D4K5 319 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr938Q9EQ93 315 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arr3Q9EQP6 381 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pole3Q9JKP7 145 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dbf4Q9QZ41 663 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hipk2Q9QZR5 1196 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem196V9GX04 182 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 5430403G16RikD3Z5L4 667 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 5430401F13RikE9Q328 175 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prdx4O08807 274 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdk5r2O35926 369 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdlim3O70209 316 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klrg1O88713 188 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdk5P49615 292 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbx5P70326 518 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2-Eb2Q3UUV9 287 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PcnpQ6P8I4 178 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eri1Q7TMF2 345 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SelenoiQ80TA1 398 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcmf1Q80UY2 381 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BspryQ80YW5 473 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc26a11Q80ZD3 593 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmbim1Q8BJZ3 309 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kiss1rQ91V45 396 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cstf1Q99LC2 431 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Yipf2Q99LP8 312 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dapp1Q9QXT1 280 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc9a6A1L3P4 702 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr601A2RS33 314 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr746E9Q840 314 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10799F7C7U2 104 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc10a1O08705 362 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Csnk2a2O54833 350 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01629 112 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01809 118 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TtkP35761 856 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd63P41731 238 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mmp7Q10738 264 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rspo3Q2TJ95 277 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcfl5Q32NY8 489 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Brf2Q3UAW9 420 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nxph1Q61200 271 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tra2aQ6PFR5 281 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Morn4Q6PGF2 146 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mgat4bQ812F8 548 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Catsper4Q8BVN3 442 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NagsQ8R4H7 527 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc35b3Q922Q5 369 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2410137M14RikQ9CWF0 162 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lypd6bQ9D7F2 191 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chst11Q9JME2 352 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ca5bQ9QZA0 317 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Srebf1Q9WTN3 1134 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LipgQ9WVG5 500 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PrknQ9WVS6 464 aa11.71□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930433I11RikA0A0U1RPT6 723 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1034A0A1L1ST14 310 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r98E9PZ56 857 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11397F6V5V4 377 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r170K7N6W9 304 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r13L7N1X2 831 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B3galt2O54905 422 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnfsf9P41274 309 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sult2a1P52843 285 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HnrnpkP61979 463 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FuzQ3UYI6 415 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930512M02RikQ5SQK8 218 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pea15Q62048 130 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr406Q7TRX0 323 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc35f1Q8BGK5 408 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam210aQ8BGY7 273 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gen1Q8BMI4 908 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lypd4Q8BVP6 246 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr157Q8C206 330 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mettl7a1Q8C6B0 244 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dlgap5Q8K4R9 808 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cadm4Q8R464 388 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grk5Q8VEB1 590 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr700Q8VFM5 316 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr935Q8VG16 308 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr669Q8VGU9 317 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpinb9gQ8VHQ1 377 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TipinQ91WA1 278 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mgat2Q921V5 442 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl22Q99JN2 634 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hint3Q9CPS6 165 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf32Q9JIT1 368 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnase2bQ9QY48 354 aa11.71□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fnd3c2A2AP83 941 aa11.7□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sac3d1A6H687 427 aa11.7□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2410141K09RikK7N769 464 aa11.7□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grap2O89100 322 aa11.7□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P03987 398 aa11.7□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fgf17P63075 216 aa11.7□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SmsP97355 366 aa11.7□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trappc13Q3TIR1 417 aa11.7□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700012B07RikQ3V0S8 276 aa11.7□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nlrc3Q5DU56 1064 aa11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 63.4 ms