RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640554.1

SDHD-209, Transcript of succinate dehydrogenase complex subunit D, human

TSL 5

Gene SDHD, Length 727 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDHD-209	ENST00000640554	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	LUZP2	Q86TE4	346 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	NFKBID	Q8NI38	313 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	C10orf82	Q8WW14	230 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	MED12	Q93074	2177 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	LRRC58	Q96CX6	371 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	DACH2	Q96NX9	599 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	FBP2	O00757	339 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	AP3D1	O14617	1153 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	ADAM11	O75078	769 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	YES1	P07947	543 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	EPX	P11678	715 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	PRF1	P14222	555 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	CD1E	P15812	388 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	TACR3	P29371	465 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	CD79B	P40259	229 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	VWA1	Q6PCB0	445 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	BEND4	Q6ZU67	534 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	NANOG	Q9H9S0	305 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	BCO1	Q9HAY6	547 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	C12orf10	Q9HB07	376 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	GALNT8	Q9NY28	637 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	CACNA1C	Q13936	2221 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554		A0A1W2PNR3	127 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	ZNF724	A8MTY0	619 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	MRAS	O14807	208 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	CYTIP	O60759	359 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	C8B	P07358	591 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	GKN3P	P0CG01	181 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	SIRPA	P78324	504 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	SLC35A1	P78382	337 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	SPATA21	Q7Z572	469 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	TRIM2	Q9C040	744 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	EMC3	Q9P0I2	261 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	MAST4	O15021	2626 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	GMNC	A6NCL1	334 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554		A8MVM7	634 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	C16orf97	H3BN30	126 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	NDUFAB1	O14561	156 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	GPR171	O14626	319 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	CASK	O14936	926 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	KRT34	O76011	436 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	MFN2	O95140	757 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	POU2F1	P14859	743 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	PPP3CB	P16298	524 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	AGTR1	P30556	359 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	PCGF2	P35227	344 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	KCNJ5	P48544	419 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	MTPN	P58546	118 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	VEZF1	Q14119	521 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	SNX32	Q86XE0	403 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	PTOV1	Q86YD1	416 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	C10orf111	Q8N326	155 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	CADM2	Q8N3J6	435 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	OR10A6	Q8NH74	314 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	PIGX	Q8TBF5	258 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	STK35	Q8TDR2	534 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SDHD-209	ENST00000640554	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37

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