RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625905.1

NELFE-214, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NELFE, Length 111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-214ENST00000625905 RNF128Q8TEB7 428 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 DDIT4LQ96D03 193 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 LRRC37BQ96QE4 947 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 OR11A1Q9GZK7 315 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 PIGMQ9H3S5 423 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 EFCAB1Q9HAE3 211 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 OSGIN1Q9UJX0 560 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 AP3M1Q9Y2T2 418 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 TMED7Q9Y3B3 224 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 EMC9Q9Y3B6 208 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 TMEM72A0PK05 275 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 CCT8L1PA6NM43 557 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 SULT2B1O00204 365 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 SYT5O00445 386 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 ZNF208O43345 1280 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 TPST1O60507 370 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 MFN2O95140 757 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 FAM107AO95990 144 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 FESP07332 822 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 CXCR1P25024 350 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 DIO1P49895 249 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 GZMMP51124 257 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 MAP2K6P52564 334 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 SLC7A2P52569 658 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 RAC3P60763 192 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 HOXC5Q00444 222 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 DMTNQ08495 405 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 MYBPHQ13203 477 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 VWA1Q6PCB0 445 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 HACD2Q6Y1H2 254 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 FCRLAQ7L513 359 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 PIGWQ7Z7B1 504 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 LUZP2Q86TE4 346 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 CALHM3Q86XJ0 350 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 ADGRG3Q86Y34 549 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 SMYD1Q8NB12 490 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 OR52E4Q8NGH9 312 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 SLC26A7Q8TE54 656 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 ABHD3Q8WU67 409 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 RASSF5Q8WWW0 418 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 ROBO4Q8WZ75 1007 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 MARVELD3Q96A59 401 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 TAMM41Q96BW9 452 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 CCT8L2Q96SF2 557 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 EVA1AQ9H8M9 152 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 GLRX2Q9NS18 164 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 PRDM4Q9UKN5 801 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 CLEC4AQ9UMR7 237 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 MED12LQ86YW9 2145 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 M0QX08 132 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 M0R3H8 397 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 NDUFAB1O14561 156 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 MSTNO14793 375 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 DNPH1O43598 174 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 PMS2P2O95744 297 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 IFNA14P01570 189 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 IGFBP2P18065 325 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 ENPP1P22413 925 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 HTR2AP28223 471 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 AGTR1P30556 359 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 IDUAP35475 653 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 PEX19P40855 299 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 CLK1P49759 484 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 LIPEQ05469 1076 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 VEZF1Q14119 521 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 GUSBP1Q15486 140 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 TMPPEQ6ZT21 453 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 CCDC80Q76M96 950 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 MICU2Q8IYU8 434 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 SLC43A2Q8N370 569 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-214ENST00000625905 CCDC197Q8NCU1 140 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms