RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 DOCK8Q8NF50 2099 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 A0A0G2JK05 382 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PRB8 838 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 H3BSH0 61 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 FADS1O60427 444 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 UBL3O95164 117 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 IGSF6O95976 241 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 LIPCP11150 499 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 IFNGR1P15260 489 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF44P15621 663 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 GABRR2P28476 465 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 CALCRP30988 508 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 RIDAP52758 137 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 ART1P52961 327 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 OR2B8PP59922 312 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 RAE1P78406 368 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 DHODHQ02127 395 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 OR7A5Q15622 319 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 SLC22A10Q63ZE4 541 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 OR10H4Q8NGA5 316 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 OR52N2Q8NGI0 321 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM19Q96HH6 336 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 MICU1Q9BPX6 476 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 PRO1933Q9H354 126 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 ANGPT4Q9Y264 503 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 NLRC5Q86WI3 1866 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 CACNA1EQ15878 2313 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1B0GUH1 482 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 URADA6NGE7 173 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 C5orf52A6NGY3 159 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 HIDE1A8MVS5 230 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 AGPAT2O15120 278 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 S100A8P05109 93 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 DAOP14920 347 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 GNSP15586 552 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 AOAHP28039 575 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 MPGP29372 298 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 CD70P32970 193 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 MTNR1BP49286 362 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 STX4Q12846 297 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 ECH1Q13011 328 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 FZD5Q13467 585 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 PEA15Q15121 130 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 LHX8Q68G74 356 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 OR52W1Q6IF63 320 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 MACC1Q6ZN28 852 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF546Q86UE3 836 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 NAXDQ8IW45 347 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 NUBPLQ8TB37 319 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 VOPP1Q96AW1 172 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 CLCC1Q96S66 551 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 CHST6Q9GZX3 395 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 SCN3AQ9NY46 2000 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 CBLCQ9ULV8 474 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 GBF1Q92538 1859 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 J3QLW9 94 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 FAAHO00519 579 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 CCSO14618 274 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 EPXP11678 715 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF19P17023 458 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 MMP15P51511 669 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 EPHA4P54764 986 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 PPIAP62937 165 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 FAM122BQ7Z309 247 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 CPXM2Q8N436 756 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 DUSP19Q8WTR2 217 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 RGMAQ96B86 450 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 SEC22AQ96IW7 307 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 FNDC11Q9BVV2 318 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 IL21RQ9HBE5 538 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 SGK2Q9HBY8 427 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRT-211ENST00000618610 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms