RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 REEP3Q6NUK4 255 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 TMPPEQ6ZT21 453 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 SLC43A2Q8N370 569 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 CLIP4Q8N3C7 705 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 CGREF1Q99674 301 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 ELOVL5Q9NYP7 299 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 EPXP11678 715 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 LSP1P33241 339 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 CPOXP36551 454 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 CDK6Q00534 326 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 ADRM1Q16186 407 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 ZNF311Q5JNZ3 666 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 ZNF550Q7Z398 422 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 NFKBIDQ8NI38 313 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 ABHD3Q8WU67 409 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 SLC35B4Q969S0 331 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 SLC39A3Q9BRY0 314 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 ADAM19Q9H013 955 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 SAR1AQ9NR31 198 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 OSGIN1Q9UJX0 560 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 FAM221AA4D161 298 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 GKN3PP0CG01 181 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 AGTR1P30556 359 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 CD79BP40259 229 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 DIO1P49895 249 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 ZNF610Q8N9Z0 462 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-220ENST00000618056 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 ZNF208O43345 1280 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 PRKD3O94806 890 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 ENPP1P22413 925 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 SLC6A2P23975 617 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 TACR3P29371 465 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 FAM27E3Q08E93 113 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 NFYCQ13952 458 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 SCARB2Q14108 478 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 COQ5Q5HYK3 327 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 LINC01560Q8TB33 94 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 KLHL13Q9P2N7 655 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 TMED7Q9Y3B3 224 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 OTOGQ6ZRI0 2925 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 AKAP9Q99996 3911 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 SULT2B1O00204 365 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 FBP2O00757 339 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 CTAG2O75638 210 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 PMS2P2O95744 297 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 TFPIP10646 304 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 PRKAR1BP31321 381 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.142e-6■■■■□ 23.8
PMS1-220ENST00000618056 KLF10Q13118 480 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 KRT73Q86Y46 540 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 C10orf82Q8WW14 230 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 ARL5BQ96KC2 179 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 DACH2Q96NX9 599 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 BCO1Q9HAY6 547 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 A6NNC1 897 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 DNPH1O43598 174 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 CYTIPO60759 359 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 POU2F1P14859 743 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 COPZ1P61923 177 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 TMEM201Q5SNT2 666 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 WBP2NLQ6ICG8 309 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 SERPINA11Q86U17 422 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 HIPK4Q8NE63 616 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 OR11A1Q9GZK7 315 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 KLHL9Q9P2J3 617 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 TRAPPC4Q9Y296 219 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 PRR14LQ5THK1 2151 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 SH3D21A4FU49 640 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 ERICH4A6NGS2 130 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 GOSR1O95249 250 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 YES1P07947 543 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 PRG2P13727 222 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 MTPNP58546 118 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 RBBP4Q09028 425 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 SELPLGQ14242 412 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 MAPRE2Q15555 327 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 TMEM200AQ86VY9 491 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 PTOV1Q86YD1 416 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 TUSC5Q8IXB3 177 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 DDIT4LQ96D03 193 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 ZNF607Q96SK3 696 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 PSD2Q9BQI7 771 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 NDRG3Q9UGV2 375 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 TMEM72A0PK05 275 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 BBIP1A8MTZ0 92 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 SLC22A2O15244 555 aa22.16■■□□□ 1.14
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