RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	SPACA6	W5XKT8	324 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768		A0A1B0GUS0	222 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768		A0A1W2PPV9	198 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	C5orf63	A6NC05	138 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	SLC22A20	A6NK97	555 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768		E7ESA3	106 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	HAT1	O14929	419 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	EMC8	O43402	210 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	HCRTR2	O43614	444 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	C1orf105	O95561	183 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	GAS8	O95995	478 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	FTH1	P02794	183 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	OR56A5	P0C7T3	313 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	ERG	P11308	486 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	CPN1	P15169	458 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	CHM	P24386	653 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	CMPK1	P30085	196 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	ELK3	P41970	407 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	TTPA	P49638	278 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	CDKN2D	P55273	166 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	DR1	Q01658	176 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	ASPH	Q12797	758 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.16	□□□□□ -1.74	5e-8	■■■□□ 15.5
MLH1-223	ENST00000616768	CUL1	Q13616	776 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	P2RY6	Q15077	328 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	PPP1R7	Q15435	360 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	DUPD1	Q68J44	220 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	OR2A2	Q6IF42	318 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	NEPRO	Q6NW34	567 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	CASC4	Q6P4E1	433 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	ADCK2	Q7Z695	626 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	RDH11	Q8TC12	318 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	CD200R1	Q8TD46	325 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC45	Q96CN5	670 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	OR1F2P	Q96R84	312 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	RHBG	Q9H310	441 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	UBQLN3	Q9H347	655 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	SNX24	Q9Y343	169 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MLH1-223	ENST00000616768	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	TXNDC9	O14530	226 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	CHST10	O43529	356 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	DNPH1	O43598	174 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	NDUFS3	O75489	264 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	ACTL6A	O96019	429 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	NGF	P01138	241 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	ARSB	P15848	533 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	PGAM1	P18669	254 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MLH1-223	ENST00000616768	JAK1	P23458	1154 aa		4.15	□□□□□ -1.75

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