RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB8AQ96BR9 441 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-206ENST00000588815 SGTBQ96EQ0 304 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
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CAPNS1-206ENST00000588815 CDH10Q9Y6N8 788 aa28.15■■■□□ 2.1
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CAPNS1-206ENST00000588815 FAM173AQ9BQD7 235 aa28.14■■■□□ 2.09
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CAPNS1-206ENST00000588815 KCNMB2Q9Y691 235 aa28.14■■■□□ 2.09
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CAPNS1-206ENST00000588815 FOXF1Q12946 379 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.09
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CAPNS1-206ENST00000588815 SIGLEC7Q9Y286 467 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-206ENST00000588815 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF337Q9Y3M9 751 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM72A0PK05 275 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-206ENST00000588815 OR7A10O76100 309 aa28.1■■■□□ 2.09
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