RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLI4P10075 376 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC7A1P30825 629 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 SGCBQ16585 318 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4D11Q8NGI4 311 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10D3Q8NH80 312 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 GORASP2Q9H8Y8 452 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM27Q9HBJ8 222 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF208O43345 1280 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 LDLRP01130 860 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 CXCR1P25024 350 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUP107P57740 925 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPTX1Q15818 432 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 HBMQ6B0K9 141 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEM1Q6ZVN7 128 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 MCHR1Q99705 422 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR14Q9BWN1 585 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRK2Q5S007 2527 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GWA3 101 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 GYG2O15488 501 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIMP3P35625 211 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLK1P49759 484 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADORA2A-AS1P86434 159 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 BNIP2Q12982 314 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR1Q1Q15612 314 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAL1Q4LDG9 190 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 CARM1Q86X55 608 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 RND1Q92730 232 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 C12orf10Q9HB07 376 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPS6KA6Q9UK32 745 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF682O95780 498 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCNA2P20248 432 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 ULK3Q6PHR2 472 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 WNT2BQ93097 391 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 DDIT4LQ96D03 193 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHAC1Q9H158 963 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 COQ10BQ9H8M1 238 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF175Q9Y473 711 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNX13Q9Y5W8 968 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 DOCK7Q96N67 2140 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM72A0PK05 275 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 WIPF3A6NGB9 483 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZG16O60844 167 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 CARD18P57730 90 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALG10BQ5I7T1 473 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 SSC4DQ8WTU2 575 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 OSTF1Q92882 214 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5B2Q96R09 309 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIGARQ9NQ88 270 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 MPDZO75970 2070 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PNR3 127 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC22A20A6NK97 555 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARPC2O15144 300 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 CXCL13O43927 109 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP5HO75947 161 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 TFPIP10646 304 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFRSF1BP20333 461 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMSP52788 366 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 PON3Q15166 354 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF613Q6PF04 617 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 TM9SF2Q99805 663 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 BTBD10Q9BSF8 475 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR11A1Q9GZK7 315 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0B4J2E0 115 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GX12 115 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR1E2P47887 323 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 RASSF2P50749 326 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 ENTPD8Q5MY95 495 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLXDC2Q6UX71 529 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 VTCN1Q7Z7D3 282 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 THTPAQ9BU02 230 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 SELENONQ9NZV5 590 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 TOXO94900 526 aa29.7■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL2RAP01589 272 aa29.7■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 PNMTP11086 282 aa29.7■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 FNDC9Q8TBE3 224 aa29.7■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa29.7■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC47A1Q96FL8 570 aa29.7■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSH2DQ96JZ2 352 aa29.7■■■□□ 2.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARL5BQ96KC2 179 aa29.7■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms