RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568290.1

ATXN3-250, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-250ENST00000568290 GABARAPH6UMI1 98 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 ACOT7O00154 380 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 BTN3A3O00478 584 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 SSNA1O43805 119 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 FCMRO60667 390 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 PTP4A3O75365 173 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 SC5DO75845 299 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 RASGRP1O95267 797 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 EGFP01133 1207 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 UCHL1P09936 223 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 UBL4AP11441 157 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 DRD1P21728 446 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 EDNRAP25101 427 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 PYCR1P32322 319 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 GABRA3P34903 492 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 IGFALSP35858 605 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 HTR2BP41595 481 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 DIO1P49895 249 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 GDI2P50395 445 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 CCR9P51686 369 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 SLC25A1P53007 311 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 METAP1P53582 386 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 DCAF7P61962 342 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 SLC3A1Q07837 685 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 CDK5R1Q15078 307 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 TOMM20Q15388 145 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 FAM189A2Q15884 450 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 ZNF141Q15928 474 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 GAB4Q2WGN9 574 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 BTBD16Q32M84 506 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 CDONQ4KMG0 1287 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 DEFB134Q4QY38 66 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 PLA1AQ53H76 456 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 ALG10BQ5I7T1 473 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 TMEM240Q5SV17 173 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 LCE2CQ5TA81 110 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 ANKRD54Q6NXT1 300 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 C5orf46Q6UWT4 87 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 TMEM91Q6ZNR0 172 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 RNF44Q7L0R7 432 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 C11orf74Q86VG3 221 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 SLC35F2Q8IXU6 374 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 FBXL6Q8N531 539 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 FAM71CQ8NEG0 241 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 OR6C4Q8NGE1 309 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 HGDQ93099 445 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 ARMC5Q96C12 935 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 NXPE2Q96DL1 559 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 SCMH1Q96GD3 660 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 RNF170Q96K19 258 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 ART5Q96L15 291 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 DGAT2Q96PD7 388 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 PLEKHA1Q9HB21 404 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 BRD7Q9NPI1 651 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 EPHA6Q9UF33 1036 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 UBQLN2Q9UHD9 624 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 NUP50Q9UKX7 468 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 ZNF281Q9Y2X9 895 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 HSPB11Q9Y547 144 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 MAB21L2Q9Y586 359 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa7.05□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 A0A0G2JMP0 313 aa7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 A0A0X1KG70 313 aa7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 OR6C74A6NCV1 312 aa7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 AIPO00170 330 aa7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 SOCS6O14544 535 aa7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 KRT33AO76009 404 aa7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 RGS11O94810 467 aa7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 GLCEO94923 617 aa7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 RENP00797 406 aa7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 IL5P05113 134 aa7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 TPOP07202 933 aa7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 ADRA2AP08913 450 aa7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 FAM157BP0CG42 384 aa7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 EPXP11678 715 aa7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 HOXB2P14652 356 aa7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 CPN1P15169 458 aa7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 FUT4P22083 530 aa7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 IGFBP4P22692 258 aa7.04□□□□□ -1.28
ATXN3-250ENST00000568290 GDI1P31150 447 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms