RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	GPR135	Q8IZ08	494 aa		16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM19	Q96E16	107 aa		16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	CAPN10	Q9HC96	672 aa		16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		16.96	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	LANCL1	O43813	399 aa		16.95	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	UBL3	O95164	117 aa		16.95	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF24	P17028	368 aa		16.95	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	16.95	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	FHL1	Q13642	323 aa		16.95	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	NTRK2	Q16620	822 aa		16.95	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	RPTN	Q6XPR3	784 aa		16.95	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	CMIP	Q8IY22	773 aa		16.95	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	THAP4	Q8WY91	577 aa		16.95	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	HYLS1	Q96M11	299 aa		16.95	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		16.95	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	16.95	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	COPZ2	Q9P299	210 aa		16.95	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	16.95	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		16.95	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	16.95	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		16.95	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	FLRT2	O43155	660 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	PPM1B	O75688	479 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	GYPB	P06028	91 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	EMD	P50402	254 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	SKP1	P63208	163 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF141	Q15928	474 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZSR6	202 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	KRT74	Q7RTS7	529 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	PEX11G	Q96HA9	241 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	ABHD1	Q96SE0	405 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	LINC01565	O15544	149 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	RDH16	O75452	317 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	NGFR	P08138	427 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	TFPI	P10646	304 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	S1PR1	P21453	382 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	MMP15	P51511	669 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	SIRPA	P78324	504 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	FGFBP1	Q14512	234 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	CDK5R1	Q15078	307 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	PON3	Q15166	354 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	ANGPT1	Q15389	498 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC58	Q4VC31	144 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	PHYHIP	Q92561	330 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	RIT1	Q92963	219 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	SGTB	Q96EQ0	304 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	STMN3	Q9NZ72	180 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		16.94	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PRG6	482 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	BLACE	A4D250	179 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	EFCAB7	A8K855	629 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	RABIF	P47224	123 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	TPMT	P51580	245 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	CDON	Q4KMG0	1287 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	SSX6	Q7RTT6	188 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	CADM2	Q8N3J6	435 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	SNX33	Q8WV41	574 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	PATE1	Q8WXA2	126 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	CMTM3	Q96MX0	182 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	MED28	Q9H204	178 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	C7orf66	A4D0T2	115 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	OR2B3	O76000	313 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	UCHL1	P09936	223 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	EPX	P11678	715 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	DRD1	P21728	446 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	GNG2	P59768	71 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	TP53I3	Q53FA7	332 aa		16.93	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		16.93	■□□□□ 0.3

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