RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	FOPNL	Q96NB1	174 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	POLE3	Q9NRF9	147 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	GNG12	Q9UBI6	72 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787		A8MUI8	341 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	GFY	I3L273	518 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	CTAGE5	O15320	804 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	MED6	O75586	246 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	KIAA0754	O94854	1291 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	MBD3	O95983	291 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	PCCB	P05166	539 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADSS	P30520	456 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	MNAT1	P51948	309 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRTAP10-8	P60410	259 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	PFN3	P60673	137 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	CNTN2	Q02246	1040 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	GGTLC2	Q14390	218 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	IL22RA2	Q969J5	263 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	C7orf34	Q96L11	122 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCNA7	Q96RP8	456 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	RS1	O15537	224 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	SNAI2	O43623	268 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	TPSB2	P20231	275 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	GLP1R	P43220	463 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	TDO2	P48775	406 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	UNC119	Q13432	240 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	TPSAB1	Q15661	275 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	BOLA3	Q53S33	107 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	KIAA1328	Q86T90	577 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	DPH5	Q9H2P9	285 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	VCPKMT	Q9H867	229 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	KIF25	Q9UIL4	384 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	HCRTR1	O43613	425 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR10H3	O60404	316 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	LGALS2	P05162	132 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	TSPY4	P0CV99	314 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	TSPY10	P0CW01	314 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	ICAM2	P13598	275 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	ATP6V1B2	P21281	511 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	HPCAL1	P37235	193 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	LEP	P41159	167 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	BID	P55957	195 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	TGFBR3	Q03167	851 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	MOB3B	Q86TA1	216 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR56B4	Q8NH76	319 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	RAET1E	Q8TD07	263 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	CALHM2	Q9HA72	323 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	LTBP1	Q14766	1721 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A0G2JRQ6	117 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	NACA	E9PAV3	2078 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787		G3V4G9	280 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	UGT1A9	O60656	530 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	AK1	P00568	194 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	HPGD	P15428	266 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	CRISP2	P16562	243 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	CALCR	P30988	508 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	KDR	P35968	1356 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	KIR2DS4	P43632	304 aa		3.06	□□□□□ -1.92

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