RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 NFATC3Q12968 1075 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 RADILQ96JH8 1075 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PLEK2Q9NYT0 353 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 DNAJB11Q9UBS4 358 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 TRIM64BA6NI03 449 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 F5H0A9 414 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 SULT1C2O00338 296 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 SIGLEC6O43699 453 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 GABRA5P31644 462 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 MTNR1BP49286 362 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 AKR1C2P52895 323 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM240Q5SV17 173 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF610Q8N9Z0 462 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 MAL2Q969L2 176 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 RGCCQ9H4X1 137 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 WDR76Q9H967 626 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 CAMK2AQ9UQM7 478 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 F5H5P2 479 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 M0R3H8 397 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 LYRM1O43325 122 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 CLDN2P57739 230 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ODF4Q2M2E3 257 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 DEFB110Q30KQ9 67 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 FAM71E1Q6IPT2 247 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 TWSG1Q9GZX9 223 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 SEMA4GQ9NTN9 838 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 RASD1Q9Y272 281 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 SLC5A10A0PJK1 596 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ARRDC5A6NEK1 342 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 A8MVM7 634 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 OR7A17O14581 309 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV3-25P01717 112 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 CTHP32929 405 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 SGSHP51688 502 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 CCNJQ5T5M9 372 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PLCXD3Q63HM9 321 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 A3GALT2U3KPV4 340 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 IFNA4P05014 189 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF806P0C7X5 589 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 TCN2P20062 427 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ABHD5Q8WTS1 349 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 JAM3Q9BX67 310 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 OPA3Q9H6K4 179 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PADI1Q9ULC6 663 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 BCORQ6W2J9 1755 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 A0A087WV62 115 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 UTS2O95399 124 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 RAB3DO95716 219 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 CPNE6O95741 557 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PIPP12273 146 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 SLC2A5P22732 501 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 DEFA5Q01523 94 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 NNATQ16517 81 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 OR4N2Q8NGD1 307 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 OR8K3Q8NH51 312 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 TM4SF18Q96CE8 201 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PLEKHA3Q9HB20 300 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 VAPAQ9P0L0 249 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 CD300LBA8K4G0 201 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 HIDE1A8MVS5 230 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 A8MXE2 369 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 H3BML4 177 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 UPK1BO75841 260 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 SERPINE2P07093 398 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 PRPH2P23942 346 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 AKR1D1P51857 326 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 LSAMPQ13449 338 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 YIF1BQ5BJH7 314 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 FRMPD2BQ6IN97 320 aa7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms