RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550335.5

HCFC2-204, Transcript of host cell factor C2, human

TSL 5

Gene HCFC2, Length 1,223 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCFC2-204	ENST00000550335	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	ARHGEF10	O15013	1369 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335		A0A0J9YWU9	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	RHBDL1	O75783	438 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	ATP5L	O75964	103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	VENTX	O95231	258 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	CAPN1	P07384	714 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	POU2F1	P14859	743 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	IMPDH1	P20839	514 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	ALDH3B2	P48448	385 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	ATP1B3	P54709	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	RND3	P61587	244 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	RUFY3	Q7L099	469 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	C10orf35	Q96D05	121 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	ZBP1	Q9H171	429 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	CUTC	Q9NTM9	273 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	EHF	Q9NZC4	300 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	PDE10A	Q9Y233	779 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	TONSL	Q96HA7	1378 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	LRP6	O75581	1613 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	ACOD1	A6NK06	481 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	SNTN	A6NMZ2	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335		E9PBE3	544 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	SH3BGRL	O75368	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	SLC2A10	O95528	541 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	REN	P00797	406 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	SLC35E2	P0CK97	266 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	MAGEA9	P43362	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	C1orf61	Q13536	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	SERTAD2	Q14140	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	SSX2	Q16385	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	DPYSL2	Q16555	572 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	BEND3	Q5T5X7	828 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335		Q8N377	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	BBS5	Q8N3I7	341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	TMEM80	Q96HE8	168 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	ZNF599	Q96NL3	588 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	TRIM15	Q9C019	465 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	IFT52	Q9Y366	437 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	EVC2	Q86UK5	1308 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335		A8MX80	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	ECI2	O75521	394 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	CD55	P08174	381 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	SLC2A3	P11169	496 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	LAMP1	P11279	417 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	GNA11	P29992	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	TPMT	P51580	245 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	SFT2D3	Q587I9	215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	NAXD	Q8IW45	347 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	PHC2	Q8IXK0	858 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	RAPGEF5	Q92565	580 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	PSMG2	Q969U7	264 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCFC2-204	ENST00000550335	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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