RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512309.1

COPB2-210, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 5

Gene COPB2, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-210ENST00000512309 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 FAM47DPA6NHR8 397 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 SOCS3O14543 225 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 ALOX15BO15296 676 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 PRPSAP2O60256 369 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 TBL1XO60907 577 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 POP4O95707 220 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 FCER2P06734 321 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 KRT5P13647 590 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 ETS1P14921 441 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 GTF2H1P32780 548 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 CD70P32970 193 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 DRD3P35462 400 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 CSKP41240 450 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 ASMTP46597 345 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 TKTL1P51854 596 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 RPL27P61353 136 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 BST2Q10589 180 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 NME3Q13232 169 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 MUC21Q5SSG8 566 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 OR6B2Q6IFH4 312 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 SPOPLQ6IQ16 392 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 GSG1LQ6UXU4 331 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 KCNMB4Q86W47 210 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 RNF130Q86XS8 419 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 SLC25A45Q8N413 288 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 ARL14Q8N4G2 192 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 BANPQ8N9N5 519 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 FBXO25Q8TCJ0 367 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 WFDC5Q8TCV5 224 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 C16orf58Q96GQ5 468 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 FAM111AQ96PZ2 611 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 ATF6BQ99941 703 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 ULBP1Q9BZM6 244 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 STARD5Q9NSY2 213 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 DEPPQ9NTK1 212 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 SPASTQ9UBP0 616 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 ERVW-1Q9UQF0 538 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 PRSS21Q9Y6M0 314 aa3.96□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 A0A0J9YWU9 116 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 SH3PXD2BA1X283 911 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 IGLON5A6NGN9 336 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 ARHGEF33A8MVX0 844 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 A8MXK9 166 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 E7ENQ6 273 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 RASGRF2O14827 1237 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 ZNF749O43361 778 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 CALUO43852 315 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 TSPAN2O60636 221 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 SNAP91O60641 907 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 YEATS4O95619 227 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 IL1BP01584 269 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 GIMD1P0DJR0 217 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 AKT2P31751 481 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 PSMD8P48556 350 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 CCL11P51671 97 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 SGSHP51688 502 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 PLK1P53350 603 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 DAOAP59103 153 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 ADIGQ0VDE8 80 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 SLC17A1Q14916 467 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 STK38Q15208 465 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 ISXQ2M1V0 245 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 MS4A13Q5J8X5 152 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 C1orf220Q5T0J3 134 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 TEX35Q5T0J7 233 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 FAM182AQ5T1J6 154 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 DCAF12Q5T6F0 453 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 DOK6Q6PKX4 331 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 WDR88Q6ZMY6 472 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 CARM1Q86X55 608 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 ELMOD2Q8IZ81 293 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 LRRC17Q8N6Y2 441 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 LINC00301Q8NCQ3 95 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 OR1B1Q8NGR6 318 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 OR8D1Q8WZ84 308 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 SERPINB11Q96P15 392 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 LRRC61Q9BV99 259 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 TRIM62Q9BVG3 475 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 TRIM15Q9C019 465 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 CXXC4Q9H2H0 198 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 CISHQ9NSE2 258 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 NINJ2Q9NZG7 142 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 KIAA1257Q9ULG3 409 aa3.95□□□□□ -1.78
COPB2-210ENST00000512309 U3KQA8 63 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms