RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 RASD2Q96D21 266 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 GPER1Q99527 375 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 HOXD1Q9GZZ0 328 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 C14orf105Q9NVL8 296 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 CACNG2Q9Y698 323 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 VWA8A3KMH1 1905 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 AKR7A2O43488 359 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 CTSVO60911 334 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 CCKBRP32239 447 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 FAUP35544 74 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 FCN2Q15485 313 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 MAPK14Q16539 360 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 DIABLOQ9NR28 239 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 RDH8Q9NYR8 311 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 FABP7O15540 132 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 MAGEB1P43366 347 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ARFIP1P53367 373 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ACTC1P68032 377 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ACTA1P68133 377 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 FGL2Q14314 439 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 NSDHLQ15738 373 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC35D2Q76EJ3 337 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 SLITRK4Q8IW52 837 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 LILRB4Q8NHJ6 448 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 COMMD9Q9P000 198 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 FBXL3Q9UKT7 428 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM129A0AVI4 362 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 SERTM1A2A2V5 107 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 GPR143P51810 404 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 CRIPAKQ8N1N5 446 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 FCAMRQ8WWV6 532 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ACOT12Q8WYK0 555 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 HHIPQ96QV1 700 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 DZANK1Q9NVP4 752 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 RCE1Q9Y256 329 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 TSPAN11A1L157 253 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM221A6NGB7 291 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 C17orf105B2RV13 164 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 GPR89AB7ZAQ6 455 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 TEX46H3BTG2 121 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 MEN1O00255 615 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 LILRB5O75023 590 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAJB6O75190 326 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 LALBAP00709 142 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 GPR89BP0CG08 455 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 GRM7Q14831 915 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 NAXEQ8NCW5 288 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 FCRL1Q96LA6 429 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 Q96M85 177 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 MAP3K3Q99759 626 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 G6PC3Q9BUM1 346 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 CD93Q9NPY3 652 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 MGAT4CQ9UBM8 478 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 GIMD1P0DJR0 217 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 BTG2P78543 158 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 CDC20Q12834 499 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 RAB30Q15771 203 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 PYHIN1Q6K0P9 492 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 FTMTQ8N4E7 242 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 WDR34Q96EX3 536 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 MSANTD3Q96H12 275 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 CTRCQ99895 268 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 TEX101Q9BY14 249 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 BCL2L10Q9HD36 194 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A0J9YY10 115 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 L7N2F9 121 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 SURF4O15260 269 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 P2RX6O15547 441 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 SELENOFO60613 162 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 NID1P14543 1247 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 LCN1P31025 176 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 FNTBP49356 437 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 STARP49675 285 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ALG10Q5BKT4 473 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ATCAYQ86WG3 371 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 PSD2Q9BQI7 771 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 PDE7BQ9NP56 450 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 LRIT1Q9P2V4 623 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 SPEF1Q9Y4P9 236 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1W2PPV9 198 aa11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms