RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 OSER1Q9NX31 292 aa3.66□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 GNB5O14775 395 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 PTHP01270 115 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 CELA3AP09093 270 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 LIFP15018 202 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 GSTM3P21266 225 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 CPT2P23786 658 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 ACRV1P26436 265 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 OR1E2P47887 323 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 FASLGP48023 281 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 CAPZA1P52907 286 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 MANFP55145 182 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 RHAGQ02094 409 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 STX4Q12846 297 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 MADCAM1Q13477 382 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 GPR176Q14439 515 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 CTSL3PQ5NE16 218 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 LIPKQ5VXJ0 399 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 SBSNQ6UWP8 590 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC29A4Q7RTT9 530 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 ADIPOR2Q86V24 386 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 APCDD1Q8J025 514 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 CADM2Q8N3J6 435 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 CLRN3Q8NCR9 226 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 OR2A12Q8NGT7 310 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 GPR151Q8TDV0 419 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 NUDT8Q8WV74 236 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 DEDD2Q8WXF8 326 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 CREB3L1Q96BA8 519 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM68Q96MH6 324 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 LRFN5Q96NI6 719 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 PITX2Q99697 317 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC26A1Q9H2B4 701 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 BRF2Q9HAW0 419 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 GPR160Q9UJ42 338 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 PARP14Q460N5 1801 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa3.65□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A1W2PRB8 838 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM210A6NLX4 147 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 FAAHO00519 579 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC19A2O60779 497 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 TNFRSF6BO95407 300 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 CLDN14O95500 239 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 AHCYP23526 432 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 ABCD3P28288 659 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 NTSP30990 170 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 MAGEA2P43356 314 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 DCDC1P59894 354 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 PFN3P60673 137 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 VAMP2P63027 116 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF763Q0D2J5 394 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 REEP3Q6NUK4 255 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 TRAT1Q6PIZ9 186 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 SUSD1Q6UWL2 747 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 PGBD5Q8N414 524 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 NATD1Q8N6N6 113 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 FRMD1Q8N878 549 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 TCEANCQ8N8B7 351 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 PSD4Q8NDX1 1056 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 OR52L1Q8NGH7 329 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 UBTD2Q8WUN7 234 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM171Q8WVE6 324 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC7A6Q92536 515 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 SNAPC3Q92966 411 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 ABHD17AQ96GS6 310 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 AIF1LQ9BQI0 150 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 EFCAB11Q9BUY7 163 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 TSSK6Q9BXA6 273 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 GABARAPL3Q9BY60 117 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 MMP28Q9H239 520 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 DPAGT1Q9H3H5 408 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 NIPAL2Q9H841 368 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 MYO10Q9HD67 2058 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 IL17CQ9P0M4 197 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 BTNL2Q9UIR0 455 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 ENPP4Q9Y6X5 453 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 WDR81Q562E7 1941 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A1B0GTL3 188 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 TUBAL3A6NHL2 446 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 ARHGEF33A8MVX0 844 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC16A5O15375 505 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-213ENST00000498524 PRKYO43930 277 aa3.65□□□□□ -1.83
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