RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STX4Q12846 297 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRM7Q14831 915 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PGGHGQ32M88 737 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SHEQ5VZ18 495 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARSKQ6UWY0 536 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD300LDQ6UXZ3 194 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2L13Q8N349 312 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB44Q8NCP5 570 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SFXN5Q8TD22 340 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGDIGQ99819 225 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC22A4Q9H015 551 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNN2Q9H2S1 579 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POMT2Q9UKY4 750 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FER1L5A0AVI2 2057 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HMX3A6NHT5 357 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PROS1P07225 676 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EFNB1P98172 346 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BTN1A1Q13410 526 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1orf189Q5VU69 101 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARL9Q6T311 187 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 QSOX2Q6ZRP7 698 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2T33Q8NG76 320 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NLKQ9UBE8 527 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAV27A0A087WT01 109 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A0G2JNG1 304 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 URADA6NGE7 173 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIR2DS3K7RE56 304 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FOXS1O43638 330 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGKV1D-16P01601 117 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYL9P24844 172 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIR2DL3P43628 341 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EMDP50402 254 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLAURQ03405 335 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIR2DS5Q14953 304 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM65Q6PI78 240 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASB18Q6ZVZ8 466 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLHL36Q8N4N3 616 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINC00471Q8N535 108 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM99Q8N816 258 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR51L1Q8NGJ5 315 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OSTF1Q92882 214 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FGF11Q92914 225 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WACQ9BTA9 647 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TEX12Q9BXU0 123 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NRSN2Q9GZP1 204 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLHL1Q9NR64 748 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM129A0AVI4 362 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CBX7O95931 251 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GABRA5P31644 462 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BNC1Q01954 994 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC3A1Q07837 685 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPTNQ6XPR3 784 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF620Q6ZNG0 422 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTLL10Q6ZVT0 673 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRR22Q8IZ63 422 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RFKQ969G6 155 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR52D1Q9H346 318 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBQLN3Q9H347 655 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LIPT1Q9Y234 373 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SDK2Q58EX2 2172 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLA2G10O15496 165 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAKP20794 623 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MGAT2Q10469 447 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TPBGQ13641 420 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XKRXQ6PP77 449 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF44Q7L0R7 432 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR13C2Q8NGS9 318 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IFT27Q9BW83 186 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CBLCQ9ULV8 474 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERVK-19Q9WJR5 959 aa14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 B4DXG7 233 aa14.29□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBXA2RP21731 343 aa14.29□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACVR1BP36896 505 aa14.29□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CBX5P45973 191 aa14.29□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCR5P51681 352 aa14.29□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DSG2Q14126 1118 aa14.29□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POU4F3Q15319 338 aa14.29□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AADACL4Q5VUY2 407 aa14.29□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VWA5B2Q8N398 1253 aa14.29□□□□□ -0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLDN22Q8N7P3 220 aa14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.3 ms