RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 ARL5BQ96KC2 179 aa18.71■□□□□ 0.59
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ACTB-211ENST00000480301 OR11A1Q9GZK7 315 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 SLC24A3Q9HC58 644 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 GALNT8Q9NY28 637 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 TMED7Q9Y3B3 224 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-211ENST00000480301 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa18.7■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 TMEM72A0PK05 275 aa18.7■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 MRASO14807 208 aa18.7■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 FRS3O43559 492 aa18.7■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 TPST1O60507 370 aa18.7■□□□□ 0.58
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ACTB-211ENST00000480301 CCNA2P20248 432 aa18.7■□□□□ 0.58
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ACTB-211ENST00000480301 CLK1P49759 484 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
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ACTB-211ENST00000480301 C11orf65Q8NCR3 313 aa18.7■□□□□ 0.58
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ACTB-211ENST00000480301 OR10A6Q8NH74 314 aa18.7■□□□□ 0.58
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF208O43345 1280 aa18.69■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 CCDC22O60826 627 aa18.69■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
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ACTB-211ENST00000480301 TFPIP10646 304 aa18.69■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 DRD4P21917 467 aa18.69■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 AQP1P29972 269 aa18.69■□□□□ 0.58
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ACTB-211ENST00000480301 MFN2O95140 757 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 AGTR1P30556 359 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 PCYT1AP49585 367 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 MAP2K6P52564 334 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 DMTNQ08495 405 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 FAM27E3Q08E93 113 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 MYBPHQ13203 477 aa18.68■□□□□ 0.58
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ACTB-211ENST00000480301 TUSC5Q8IXB3 177 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 SLC43A2Q8N370 569 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 POU5F2Q8N7G0 328 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 LINC01560Q8TB33 94 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 DNAJA3Q96EY1 480 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 SH3GL1Q99961 368 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 ZNF559Q9BR84 538 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 GP6Q9HCN6 339 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 GMNCA6NCL1 334 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 PRORSD1PA6NEY8 169 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 TUBAL3A6NHL2 446 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 CYTIPO60759 359 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 SERPINB7O75635 380 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 PMS2P2O95744 297 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 CPOXP36551 454 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 CD79BP40259 229 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP10-9P60411 292 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 CALHM3Q86XJ0 350 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 ARMC8Q8IUR7 673 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 C3orf49Q96BT1 292 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 DDIT4LQ96D03 193 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 RCN3Q96D15 328 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 PSD2Q9BQI7 771 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-211ENST00000480301 FAM107BQ9H098 131 aa18.67■□□□□ 0.58
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