RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 NIPAL2Q9H841 368 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 PHF11Q9UIL8 331 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 NUP50Q9UKX7 468 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 COPS3Q9UNS2 423 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 USP6P35125 1406 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF27Q86VH2 1401 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.93□□□□□ -1.62
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RABGGTB-209ENST00000473406 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
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RABGGTB-209ENST00000473406 PAX5Q02548 391 aa4.93□□□□□ -1.62
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RABGGTB-209ENST00000473406 SASS6Q6UVJ0 657 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 HSDL2Q6YN16 418 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00523Q86TU6 105 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF130Q86XS8 419 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 IQCF2Q8IXL9 164 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 AQP11Q8NBQ7 271 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 B3GNT7Q8NFL0 401 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 OR52H1Q8NGJ2 320 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.628e-8■□□□□ 8.5
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RABGGTB-209ENST00000473406 P2RY13Q9BPV8 354 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 SYT15Q9BQS2 421 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 OCR1Q9BZK8 76 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF385DQ9H6B1 395 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 LYRM4Q9HD34 91 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 NANSQ9NR45 359 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
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RABGGTB-209ENST00000473406 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa4.93□□□□□ -1.62
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RABGGTB-209ENST00000473406 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 VSTM2BA6NLU5 285 aa4.92□□□□□ -1.62
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RABGGTB-209ENST00000473406 IDSB3KWA1 339 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 E7ESA3 106 aa4.92□□□□□ -1.62
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RABGGTB-209ENST00000473406 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
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RABGGTB-209ENST00000473406 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.623e-10■■□□□ 13.3
RABGGTB-209ENST00000473406 STOMP27105 288 aa4.92□□□□□ -1.62
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RABGGTB-209ENST00000473406 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
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RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM50BP56557 158 aa4.92□□□□□ -1.62
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RABGGTB-209ENST00000473406 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 DUSP7Q16829 419 aa4.92□□□□□ -1.62
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RABGGTB-209ENST00000473406 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
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RABGGTB-209ENST00000473406 MTCH1Q9NZJ7 389 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM181Q9P2C4 612 aa4.92□□□□□ -1.62
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RABGGTB-209ENST00000473406 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 SCN5AQ14524 2016 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 CHMP2AO43633 222 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 LYPD3O95274 346 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 GNA14O95837 355 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 NPPAP01160 153 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 SERPINB2P05120 415 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 UMPSP11172 480 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
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