RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	OR7G2	Q8NG99	324 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM163	Q8TC26	289 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	IGSF8	Q969P0	613 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	C10orf35	Q96D05	121 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	LGALS12	Q96DT0	336 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	OR5M11	Q96RB7	305 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	FMO2	Q99518	471 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	FOXB1	Q99853	325 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	HDAC8	Q9BY41	377 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	LAT2	Q9GZY6	243 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	GAREM1	Q9H706	876 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	WDR41	Q9HAD4	459 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	BEX1	Q9HBH7	125 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398		U3KQE9	123 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	KIAA0232	Q92628	1395 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SOGA1	O94964	1423 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	CLDN34	H7C241	214 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	FADS1	O60427	444 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	RP2	O75695	350 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ZBTB7A	O95365	584 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	HP	P00738	406 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ETFA	P13804	333 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	MYOG	P15173	224 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	BMP7	P18075	431 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	CXCR1	P25024	350 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	CALML3	P27482	149 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ADORA2A	P29274	412 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	EPHA2	P29317	976 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	FMO3	P31513	532 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	MATK	P42679	507 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	HLCS	P50747	726 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	GPR143	P51810	404 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF134	P52741	427 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	LBX1	P52954	281 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	OR4D2	P58180	307 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	GTF2B	Q00403	316 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SORD	Q00796	357 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ROM1	Q03395	351 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SEMA3B	Q13214	749 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	VGLL4	Q14135	290 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	CYP1B1	Q16678	543 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	DOK6	Q6PKX4	331 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ATRAID	Q6UW56	229 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	MDGA2	Q7Z553	956 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	C4orf19	Q8IY42	314 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	GALNT16	Q8N428	558 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	ABHD4	Q8TB40	342 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM234	Q8WY98	164 aa		2.93	□□□□□ -1.94

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