RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469297.1

CACNA2D1-208, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, human

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 413 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		5	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		5	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297		E7ENQ6	273 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	P2RX6	O15547	441 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PCDH7	O60245	1069 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PEX11A	O75192	247 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CTSL	P07711	333 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CD99	P14209	185 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	C4BPB	P20851	252 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	F8A1	P23610	371 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ALDH3B1	P43353	468 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ACADSB	P45954	432 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CCR4	P51679	360 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	LIMK2	P53671	638 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PFN3	P60673	137 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OR1C1	Q15619	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297		Q6ZVQ6	151 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RNF148	Q8N7C7	305 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NODAL	Q96S42	347 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ATR	Q13535	2644 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297		A0A087WW49	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	MCF2L	O15068	1137 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ALOX15B	O15296	676 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	LRRTM2	O43300	516 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ANXA9	O76027	345 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	AK1	P00568	194 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	IGLV3-25	P01717	112 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ALPI	P09923	528 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	COX6B1	P14854	86 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ADIG	Q0VDE8	80 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NME3	Q13232	169 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SCGB2A2	Q13296	93 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ELOC	Q15369	112 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TAB1	Q15750	504 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	AGK	Q53H12	422 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	IL23R	Q5VWK5	629 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	LIPJ	Q5W064	366 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297		Q6ZSR9	355 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PARP8	Q8N3A8	854 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	UBA3	Q8TBC4	463 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RNF139	Q8WU17	664 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SHC3	Q92529	594 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CTRC	Q99895	268 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	DYRK4	Q9NR20	520 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNA2D1-208	ENST00000469297	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61

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