RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462421.1

DDX39B-216, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 618 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-216ENST00000462421 TGFBR3Q03167 851 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 SCARB2Q14108 478 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 P2RY6Q15077 328 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 BEX5Q5H9J7 111 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 COX20Q5RI15 118 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 RNF220Q5VTB9 566 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 TMEM225Q6GV28 225 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 KLHL17Q6TDP4 642 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 C5orf46Q6UWT4 87 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 CASP12Q6UXS9 341 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 CDC20BQ86Y33 519 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 WFDC8Q8IUA0 241 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 ARMC8Q8IUR7 673 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 TUSC5Q8IXB3 177 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 C10orf53Q8N6V4 93 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 ACBD4Q8NC06 268 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 C11orf65Q8NCR3 313 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 HIPK4Q8NE63 616 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 POC1BQ8TC44 478 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 ABHD3Q8WU67 409 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 SLC38A5Q8WUX1 472 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 STON2Q8WXE9 905 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 HSD17B8Q92506 261 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 GTF2H4Q92759 462 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 EPYCQ99645 322 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 KCNS3Q9BQ31 491 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 EBF4Q9BQW3 602 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 ACTR6Q9GZN1 396 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 OR10A4Q9H209 315 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 SLC38A1Q9H2H9 487 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 UBTD1Q9HAC8 227 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 TMEM27Q9HBJ8 222 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 CTPS2Q9NRF8 586 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 GID8Q9NWU2 228 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 TESMINQ9Y4I5 508 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF407Q9C0G0 2248 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 GTF3C1Q12789 2109 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 NOTCH2Q04721 2471 aa8□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF724A8MTY0 619 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 FAAHO00519 579 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 OIP5O43482 229 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 CYTIPO60759 359 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 GMNNO75496 209 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 PNMTP11086 282 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 IL11P20809 199 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 PRKAR1BP31321 381 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 RBBP4Q09028 425 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 EPS8Q12929 822 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 C1DQ13901 141 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 MAPK14Q16539 360 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF836Q6ZNA1 936 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 OLIG3Q7RTU3 272 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 MAVSQ7Z434 540 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 GPAT4Q86UL3 456 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 VRK2Q86Y07 508 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 P3H2Q8IVL5 708 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 FAM71CQ8NEG0 241 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 OR52E4Q8NGH9 312 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 NFKBIDQ8NI38 313 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 TSPEARQ8WU66 669 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 PIGTQ969N2 578 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 SLC35B4Q969S0 331 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 ADGRG7Q96K78 797 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 CCL19Q99731 98 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 ECSITQ9BQ95 431 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 SRXN1Q9BYN0 137 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 POTEKPQ9BYX7 375 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 TRIM2Q9C040 744 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 FAIMQ9NVQ4 179 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 ADPRHL2Q9NX46 363 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 POU2F3Q9UKI9 436 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 TRAPPC4Q9Y296 219 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 AP3M1Q9Y2T2 418 aa7.99□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 DNAJC13O75165 2243 aa7.98□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 CDHR4A6H8M9 788 aa7.98□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 OR6C65A6NJZ3 312 aa7.98□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 A8MVM7 634 aa7.98□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 AP3D1O14617 1153 aa7.98□□□□□ -1.13
DDX39B-216ENST00000462421 OR2T1O43869 369 aa7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms