RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	ASCL1	P50553	236 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TFF3	Q07654	80 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	DMTN	Q08495	405 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	KRT72	Q14CN4	511 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	ACBD4	Q8NC06	268 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	DDIT4L	Q96D03	193 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF559	Q9BR84	538 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM2	Q9C040	744 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241		A1L4Q6	167 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	LGI1	O95970	557 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TACR3	P29371	465 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	AQP1	P29972	269 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	NCALD	P61601	193 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	GUSBP1	Q15486	140 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	CDSN	Q15517	529 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	MICU2	Q8IYU8	434 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	RNF128	Q8TEB7	428 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	FIG4	Q92562	907 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	CMTM6	Q9NX76	183 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	JKAMP	Q9P055	326 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	BAG5	Q9UL15	447 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PNV4	684 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TPST1	O60507	370 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TNFSF13	O75888	250 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	PNMT	P11086	282 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	BMP5	P22003	454 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	CXCR1	P25024	350 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SHC1	P29353	583 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	DIO1	P49895	249 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SLC7A2	P52569	658 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	NRF1	Q16656	503 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SPATS1	Q496A3	300 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	STK35	Q8TDR2	534 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	C3orf49	Q96BT1	292 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TAMM41	Q96BW9	452 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	OR5B2	Q96R09	309 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGDIG	Q99819	225 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	ALG2	Q9H553	416 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241		A8MVM7	634 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	SULT2B1	O00204	365 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	MSTN	O14793	375 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	AQP8	O94778	261 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	OPN1LW	P04000	364 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	CD8B	P10966	210 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	PRG2	P13727	222 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	IGFBP2	P18065	325 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	CD247	P20963	164 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	PSME3	P61289	254 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	LIPE	Q05469	1076 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	PDK3	Q15120	406 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	DUSP7	Q16829	419 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	ULK3	Q6PHR2	472 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	FCRLA	Q7L513	359 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PTPA-222	ENST00000445241	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms