RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 SOCS7O14512 581 aa16.02■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 NAT6Q93015 286 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 TOX2Q96NM4 488 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM45AQ9NWC5 275 aa16.02■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 SBSNQ6UWP8 590 aa16■□□□□ 0.15
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PTPRF-209ENST00000438120 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa15.99■□□□□ 0.15
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