RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 DUX4L6P0CJ89 424 aa15.58■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 DUX4L7P0CJ90 424 aa15.58■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 VEGFCP49767 419 aa15.58■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 PDE7AQ13946 482 aa15.58■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 TSC22D1Q15714 1073 aa15.58■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 OR5M10Q6IEU7 315 aa15.58■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 ADNP2Q6IQ32 1131 aa15.58■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 IQCHQ86VS3 1027 aa15.58■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa15.58■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 C7orf57Q8NEG2 295 aa15.58■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 THAP4Q8WY91 577 aa15.58■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 KAT2AQ92830 837 aa15.58■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 SLC6A20Q9NP91 592 aa15.58■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 BABAM2Q9NXR7 383 aa15.58■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 DUX4Q9UBX2 424 aa15.58■□□□□ 0.09
CNGA3-205ENST00000436404 ABCA7Q8IZY2 2146 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 GFYI3L273 518 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 RASGRP1O95267 797 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 SIX6O95475 246 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 HIST1H2ABP04908 130 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 IFNGR1P15260 489 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 ERVK-25P63136 954 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 MC2RQ01718 297 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 MC1RQ01726 317 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 TSSK4Q6SA08 328 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 HIST1H2ACQ93077 130 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 ELP4Q96EB1 424 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 WFDC6Q9BQY6 131 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 SEMA4CQ9C0C4 833 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 ARL6Q9H0F7 186 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 EGLN3Q9H6Z9 239 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 TM7SF3Q9NS93 570 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 NTMQ9P121 344 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 ERVK-19Q9WJR5 959 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 A0A0G2JK05 382 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 A0A1W2PRB8 838 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 SLC5A10A0PJK1 596 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 SLC16A5O15375 505 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 SIGLEC5O15389 551 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 TDGF1P13385 188 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 RPL3P39023 403 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 OR6V1Q8N148 313 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 SLC22A8Q8TCC7 542 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 RGMAQ96B86 450 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM19Q96HH6 336 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 FNDC11Q9BVV2 318 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 OR10A4Q9H209 315 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 A4GALTQ9NPC4 353 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 SLC23A2Q9UGH3 650 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 PGRMC2O15173 223 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 ARPC5O15511 151 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 GATBO75879 557 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 SLCO2B1O94956 709 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 MPC1LP0DKB6 136 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 UQCRC2P22695 453 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 E2F1Q01094 437 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM44Q2T9K0 475 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 UAP1L1Q3KQV9 507 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 SLC9B2Q86UD5 537 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 MEIOBQ8N635 442 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 SLC25A32Q9H2D1 315 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 CAMK2AQ9UQM7 478 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 CTDSPLO15194 276 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 POP7O75817 140 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 AQP8O94778 261 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 UBXN7O94888 489 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 RAB3BP20337 219 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 RORAP35398 523 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 PREPP48147 710 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 DEFB119Q8N690 84 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 PXT1Q8NFP0 134 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 FGF22Q9HCT0 170 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 A0A1W2PPC4 97 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 M0R296 226 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 SNAPINO95295 136 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 ACP5P13686 325 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-205ENST00000436404 BCKDHBP21953 392 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms