RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa18.54■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 KBTBD8Q8NFY9 601 aa18.54■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 PIGXQ8TBF5 258 aa18.54■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 PMM1Q92871 262 aa18.54■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ZG16BQ96DA0 208 aa18.54■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 MUCL1Q96DR8 90 aa18.54■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ARL5BQ96KC2 179 aa18.54■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 AIG1Q9NVV5 245 aa18.54■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 TRAPPC4Q9Y296 219 aa18.54■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PP18 115 aa18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 OR5H1A6NKK0 313 aa18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 FAAHO00519 579 aa18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 GPR171O14626 319 aa18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 MAP2K6P52564 334 aa18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 CHRNEQ04844 493 aa18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 STK11Q15831 433 aa18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 CLEC12BQ2HXU8 276 aa18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 PGGHGQ32M88 737 aa18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 GPAT3Q53EU6 434 aa18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA19Q7Z5L4 167 aa18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 NEUROG1Q92886 237 aa18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 RADILQ96JH8 1075 aa18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 TEX37Q96LM6 180 aa18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 PARD6BQ9BYG5 372 aa18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 SLC38A1Q9H2H9 487 aa18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 MALT1Q9UDY8 824 aa18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 PRDM4Q9UKN5 801 aa18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 RAB21Q9UL25 225 aa18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 USF3Q68DE3 2245 aa18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 AGAP5A6NIR3 686 aa18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 C9JVG2 144 aa18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ADAM11O75078 769 aa18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 PGRP06401 933 aa18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 TFPIP10646 304 aa18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 IDUAP35475 653 aa18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEA8P43361 318 aa18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 H3F3AP84243 136 aa18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 PPP2R2BQ00005 443 aa18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 BST1Q10588 318 aa18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 TNK1Q13470 666 aa18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 DTX2Q86UW9 622 aa18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 RNF130Q86XS8 419 aa18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ADGRG3Q86Y34 549 aa18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 APH1AQ96BI3 265 aa18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 PANX1Q96RD7 426 aa18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 FAIMQ9NVQ4 179 aa18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 PNPOQ9NVS9 261 aa18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 V9GYY5 206 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
LIMS1-208ENST00000428064 HIVEP2P31629 2446 aa18.51■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC154A6NI56 674 aa18.51■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 CLDN24A6NM45 220 aa18.51■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 SHISA9B4DS77 424 aa18.51■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 SDHDO14521 159 aa18.51■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF208O43345 1280 aa18.51■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 RYKP34925 604 aa18.51■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 IDH2P48735 452 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 UFM1P61960 85 aa18.51■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 CEP85LQ5SZL2 805 aa18.51■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 DNM1P46Q6ZS02 220 aa18.51■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 TAS2R16Q9NYV7 291 aa18.51■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 NPAP1Q9NZP6 1156 aa18.51■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM181Q9P2C4 612 aa18.51■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 MGAT4BQ9UQ53 548 aa18.51■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 INAFM1C9JVW0 142 aa18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 C1QCP02747 245 aa18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 CHRM4P08173 479 aa18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 PCSK6P29122 969 aa18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP1-1Q07627 177 aa18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 VEZF1Q14119 521 aa18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 GNA13Q14344 377 aa18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 SYPL1Q16563 259 aa18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 PRIMA1Q86XR5 153 aa18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 ANKFN1Q8N957 763 aa18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 DDIT4LQ96D03 193 aa18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 OR11A1Q9GZK7 315 aa18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 ALG2Q9H553 416 aa18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 KCNK9Q9NPC2 374 aa18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 ASB6Q9NWX5 421 aa18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 GPR45Q9Y5Y3 372 aa18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 TLN2Q9Y4G6 2542 aa18.5■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa18.49■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 ABCD4O14678 606 aa18.49■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 HDAC3O15379 428 aa18.49■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 RAMP1O60894 148 aa18.49■□□□□ 0.55
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