RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNK6Q9Y257 313 aa16.95■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 UNC119BA6NIH7 251 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 CLUP10909 449 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 EPXP11678 715 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 VEGFCP49767 419 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 CCR9P51686 369 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 TAS2R43P59537 309 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF234Q14588 700 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF273Q14593 569 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 TFAP2EQ6VUC0 442 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB42Q8N4Z0 105 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM71CQ8NEG0 241 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 OR7G2Q8NG99 324 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 PTP4A1Q93096 173 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXW5Q969U6 566 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 PRSS27Q9BQR3 290 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 OR10A4Q9H209 315 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 FN3KQ9H479 309 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1W2PPK0 400 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 L7N2F9 121 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 POU2F2P09086 479 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 GKN3PP0CG01 181 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 NOS3P29474 1203 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF136P52737 540 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 ZMYND11Q15326 602 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 MAPK14Q16539 360 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM255AQ5JRV8 349 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 METTL11BQ5VVY1 283 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 THSD4Q6ZMP0 1018 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 CFAP77Q6ZQR2 320 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 ASPGQ86U10 573 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 OR52L1Q8NGH7 329 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 SMARCD2Q92925 531 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 TTTY10Q9BZA0 68 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 HRASLSQ9HDD0 168 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 CD93Q9NPY3 652 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 NANSQ9NR45 359 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 MGAT4CQ9UBM8 478 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXL4Q9UKA2 621 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR45Q9Y484 360 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 IL9P15248 144 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 NRG3P56975 720 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 OR12D2P58182 307 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF85Q03923 595 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM69AQ5T7M9 428 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 PIGKQ92643 395 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 GHSRQ92847 366 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 CD180Q99467 661 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 PBX4Q9BYU1 374 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 SCN2AQ99250 2005 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1B0GUH1 482 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC22A23A1A5C7 686 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 CDHR4A6H8M9 788 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 NMBP08949 121 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 ARFIP1P53367 373 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR68Q15743 365 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 TANGO2Q6ICL3 276 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 MFSD12Q6NUT3 480 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 OR5J2Q8NH18 312 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 DOK4Q8TEW6 326 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 TEAD3Q99594 435 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 SEC22CQ9BRL7 303 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 SPHK1Q9NYA1 384 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 RCE1Q9Y256 329 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 A8MXK9 166 aa16.92■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 KRBOX1C9JBD0 128 aa16.92■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 SCAMP1O15126 338 aa16.92■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 NARSO43776 548 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 TPPPO94811 219 aa16.92■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 ASGR2P07307 311 aa16.92■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 PRKACAP17612 351 aa16.92■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 BMP7P18075 431 aa16.92■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 HTR2AP28223 471 aa16.92■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 BTN3A2P78410 334 aa16.92■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT33BQ14525 404 aa16.92■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 SPICQ8N5J4 248 aa16.92■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 CYB561A3Q8NBI2 242 aa16.92■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 SGTBQ96EQ0 304 aa16.92■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 HS6ST2Q96MM7 605 aa16.92■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 CA10Q9NS85 328 aa16.92■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 OR6C65A6NJZ3 312 aa16.92■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 GYPBP06028 91 aa16.92■□□□□ 0.3
RALGPS1-208ENST00000424082 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms