RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5V1Q9UGF6 321 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MOKQ9UQ07 419 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ASF1AQ9Y294 204 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CACNG2Q9Y698 323 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKDD1BA6NHY2 528 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MID1O15344 667 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GABRA1P14867 456 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 C9orf50Q5SZB4 431 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM46CQ5VWP2 391 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PLBD1Q6P4A8 553 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NUDT18Q6ZVK8 323 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DTX1Q86Y01 620 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CAMKK1Q8N5S9 505 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR56B4Q8NH76 319 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NT5CQ8TCD5 201 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NACC2Q96BF6 587 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PQF6 199 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PRG6 482 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR6C68A6NDL8 312 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 BNIP3LO60238 219 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GIFP27352 417 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB25P57735 213 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM81Q6P7N7 255 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RTL10Q7L3V2 364 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC28AQ8IWP9 274 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT78Q8N1N4 520 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2T33Q8NG76 320 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR13C2Q8NGS9 318 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PFN4Q8NHR9 129 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TIMM29Q9BSF4 260 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LIN7BQ9HAP6 207 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 IL36AQ9UHA7 158 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CEP250Q9BV73 2442 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR89AB7ZAQ6 455 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRN3E7EW58 273 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF197O14709 1029 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF254O75437 659 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR89BP0CG08 455 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 EPCAMP16422 314 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PITPNBP48739 271 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ST3GAL3Q11203 375 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 POM121L1PQ3SYA9 428 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FCRL6Q6DN72 434 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PYHIN1Q6K0P9 492 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 AMZ2Q86W34 360 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF595Q8IYB9 648 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MFSD9Q8NBP5 474 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5M9Q8NGP3 310 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 C3orf49Q96BT1 292 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 AMELYQ99218 206 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FNDC11Q9BVV2 318 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRN3Q9H3W5 708 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MGAT4AQ9UM21 535 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FLVCR2Q9UPI3 526 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GSAPA4D1B5 854 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 C5orf67F2Z3F1 127 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OIP5O43482 229 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC19A2O60779 497 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 EFCAB14O75071 495 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 B3GALNT1O75752 331 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFB6O95139 128 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 WNT11O96014 354 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PRNPP04156 253 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HMGN1P05114 100 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 APEHP13798 732 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PYCR1P32322 319 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 IGFALSP35858 605 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 C1DQ13901 141 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 QPRTQ15274 297 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF311Q5JNZ3 666 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR7E24Q6IFN5 339 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD54Q6NXT1 300 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 APOOLQ6UXV4 268 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC116Q8IYX3 515 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 STPG2Q8N412 459 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2T35Q8NGX2 323 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf216Q8TAB5 229 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 AP3S1Q92572 193 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FGF13Q92913 245 aa3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms