RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 RAC3P60763 192 aa13.81□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 PSME3P61289 254 aa13.81□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 LIPEQ05469 1076 aa13.81□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 DMTNQ08495 405 aa13.81□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT72Q14CN4 511 aa13.81□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF787Q6DD87 383 aa13.81□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ADGRG3Q86Y34 549 aa13.81□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 MCEMP1Q8IX19 187 aa13.81□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 MICU2Q8IYU8 434 aa13.81□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 FNDC9Q8TBE3 224 aa13.81□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 FIG4Q92562 907 aa13.81□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF524Q96C55 264 aa13.81□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa13.81□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF559Q9BR84 538 aa13.81□□□□□ -0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 SELENONQ9NZV5 590 aa13.81□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa13.81□□□□□ -0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 FAM90A27PA6NNH2 459 aa13.8□□□□□ -0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 PRG2P13727 222 aa13.8□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 BMP5P22003 454 aa13.8□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNJ5P48544 419 aa13.8□□□□□ -0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 TMPPEQ6ZT21 453 aa13.8□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC43A2Q8N370 569 aa13.8□□□□□ -0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 SMYD1Q8NB12 490 aa13.8□□□□□ -0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 BCAS4Q8TDM0 211 aa13.8□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 PROX1Q92786 737 aa13.8□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 PIGMQ9H3S5 423 aa13.8□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF122Q9H9V4 155 aa13.8□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa13.8□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 SHC1P29353 583 aa13.79□□□□□ -0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 TAMM41Q96BW9 452 aa13.79□□□□□ -0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 ARL8BQ9NVJ2 186 aa13.79□□□□□ -0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 A8MVM7 634 aa13.78□□□□□ -0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 PMS2P2O95744 297 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 OPN1SWP03999 348 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 PNMTP11086 282 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ENPP1P22413 925 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 DIO1P49895 249 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 HOXC5Q00444 222 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 DUSP7Q16829 419 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ELOA3BQ3SY89 546 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa13.78□□□□□ -0.2
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