RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 PRRC1Q96M27 445 aa26.77■■□□□ 1.88
ECHS1-201ENST00000368547 PSD2Q9BQI7 771 aa26.77■■□□□ 1.88
ECHS1-201ENST00000368547 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
ECHS1-201ENST00000368547 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
ECHS1-201ENST00000368547 A4GNTQ9UNA3 340 aa26.77■■□□□ 1.88
ECHS1-201ENST00000368547 AP4B1Q9Y6B7 739 aa26.77■■□□□ 1.88
ECHS1-201ENST00000368547 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa26.76■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 SLC1A3P43003 542 aa26.76■■□□□ 1.87
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ECHS1-201ENST00000368547 RFX4Q33E94 735 aa26.76■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 HS3ST5Q8IZT8 346 aa26.76■■□□□ 1.87
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ECHS1-201ENST00000368547 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 ARRDC5A6NEK1 342 aa26.76■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 RAET1LQ5VY80 246 aa26.76■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa26.76■■□□□ 1.87
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ECHS1-201ENST00000368547 NPIPA5E9PKD4 350 aa26.75■■□□□ 1.87
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ECHS1-201ENST00000368547 A0A1B0GWA3 101 aa26.74■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1W2PRQ8 180 aa26.74■■□□□ 1.87
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A53Q5H9E4 307 aa26.74■■□□□ 1.87
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ECHS1-201ENST00000368547 GRINAQ7Z429 371 aa26.74■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 OFCC1Q8IZS5 231 aa26.74■■□□□ 1.87
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ECHS1-201ENST00000368547 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 C3orf49Q96BT1 292 aa26.73■■□□□ 1.87
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ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD19PQ9H560 264 aa26.73■■□□□ 1.87
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ECHS1-201ENST00000368547 ORC6Q9Y5N6 252 aa26.73■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0B4J2E0 115 aa26.72■■□□□ 1.87
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ECHS1-201ENST00000368547 RAD23AP54725 363 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 B3GALT5-AS1P59052 145 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa26.72■■□□□ 1.87
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ECHS1-201ENST00000368547 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
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ECHS1-201ENST00000368547 FNDC11Q9BVV2 318 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
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ECHS1-201ENST00000368547 TRAPPC13A5PLN9 417 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 H0YAE9 185 aa26.72■■□□□ 1.87
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ECHS1-201ENST00000368547 ALG10BQ5I7T1 473 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 C6orf52Q5T4I8 152 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 ULK3Q6PHR2 472 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 MARVELD2Q8N4S9 558 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 OR52J3Q8NH60 311 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 RNF217Q8TC41 542 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
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ECHS1-201ENST00000368547 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
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