RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF740Q8NDX6 193 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR4D5Q8NGN0 318 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 C7orf33Q8WU49 177 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 HTR3CQ8WXA8 447 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 RLN3Q8WXF3 142 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELSPBP1Q96BH3 223 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM101Q96IK0 257 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 PGLYRP4Q96LB8 373 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 TGM7Q96PF1 710 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBX15Q96SF7 602 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGDIGQ99819 225 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERP44Q9BS26 406 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLGRKTQ9HBL7 147 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 APMAPQ9HDC9 416 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB18Q9NP72 206 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 UFSP2Q9NUQ7 469 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 TREM2Q9NZC2 230 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL36GQ9NZH8 169 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIPOXQ9P0Z9 390 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 COPS3Q9UNS2 423 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDH10Q9Y6N8 788 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1B0GUS0 222 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIP1O00291 1037 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAGEB3O15480 346 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF861PO60384 105 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 SUPT7LO94864 414 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNAPINO95295 136 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSMCR30P0CW71 290 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 MGMTP16455 207 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 HNF1AP20823 631 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 MMP11P24347 488 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD1BP29016 333 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 SHMT2P34897 504 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP3K8P41279 467 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 IFNAR2P48551 515 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 APOC4P55056 127 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 SELENOTP62341 195 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 NSDHLQ15738 373 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 CFAP157Q5JU67 520 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 GALNT17Q6IS24 598 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL34Q6ZMJ4 242 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 GDPD3Q7L5L3 318 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC50Q8IVM0 306 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC34A3Q8N130 599 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM123Q8N131 208 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEIL3Q8TAT5 605 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 ST8SIA1Q92185 356 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 NANOGQ9H9S0 305 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 POPDC2Q9HBU9 364 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERVW-1Q9UQF0 538 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGAP23Q9P227 1491 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLSPNQ9HAW4 1339 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A0G2JRQ6 117 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 METTL21EPA6NDL7 271 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRRG1O14668 218 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARPC3O15145 178 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 HCRTR1O43613 425 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 PFKFB2O60825 505 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCGNO76038 276 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 AP2A1O95782 977 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHG4P01861 327 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC130P13994 396 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 COX5AP20674 150 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP6V1B2P21281 511 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 COX7A1P24310 79 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 HTR1EP28566 365 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 GCAP28676 217 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLK7P49862 253 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 PKNOX1P55347 436 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1orf61Q13536 156 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPRC6AQ5T6X5 926 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1orf146Q5VVC0 180 aa1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms