RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291386.3

SSU72-201, Transcript of SSU72 homolog, RNA polymerase II CTD phosphatase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SSU72, Length 1,290 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72-201ENST00000291386 HOXC5Q00444 222 aa24.13■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 PON3Q15166 354 aa24.13■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 POMZP3Q6PJE2 187 aa24.13■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa24.13■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 LILRB4Q8NHJ6 448 aa24.13■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 FIG4Q92562 907 aa24.13■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 WFDC6Q9BQY6 131 aa24.13■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 ZNF559Q9BR84 538 aa24.13■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 TIGARQ9NQ88 270 aa24.13■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 ADA2Q9NZK5 511 aa24.13■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 BAG5Q9UL15 447 aa24.13■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 TMEM72A0PK05 275 aa24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 TMEM229AB2RXF0 380 aa24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 CXCR6O00574 342 aa24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 FCGR2AP12318 317 aa24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 HTR2AP28223 471 aa24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 HTR1EP28566 365 aa24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 SLC7A1P30825 629 aa24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 CPOXP36551 454 aa24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 SPATS1Q496A3 300 aa24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 OR2A2Q6IF42 318 aa24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 C6orf89Q6UWU4 347 aa24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 PLXDC2Q6UX71 529 aa24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 OR52E4Q8NGH9 312 aa24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 FNDC9Q8TBE3 224 aa24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 RNF122Q9H9V4 155 aa24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa24.12■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 B2RBV5 119 aa24.11■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 TPST2O60704 377 aa24.11■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 IL18BPO95998 194 aa24.11■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 HSD17B1P14061 328 aa24.11■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 RAC3P60763 192 aa24.11■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 MXRA7P84157 204 aa24.11■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 CDSNQ15517 529 aa24.11■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 FXNQ16595 210 aa24.11■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 TMPPEQ6ZT21 453 aa24.11■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 P4HA3Q7Z4N8 544 aa24.11■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa24.11■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 DDIT4LQ96D03 193 aa24.11■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 CD300AQ9UGN4 299 aa24.11■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 M0R3H8 397 aa24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 GSTA4O15217 222 aa24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 SYNGR4O95473 234 aa24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 CRHP06850 196 aa24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 GGT1P19440 569 aa24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 CXCR1P25024 350 aa24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 CTSSP25774 331 aa24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 NCALDP61601 193 aa24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 SELENOWP63302 87 aa24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 CYBRD1Q53TN4 286 aa24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 DEFB107AQ8IZN7 70 aa24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 OR6T1Q8NGN1 323 aa24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 PROX1Q92786 737 aa24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 OR5B2Q96R09 309 aa24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 CDRT15Q96T59 188 aa24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 SRXN1Q9BYN0 137 aa24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 POTEKPQ9BYX7 375 aa24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 TMEM27Q9HBJ8 222 aa24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa24.1■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 A0A1B0GWA3 101 aa24.09■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 A0A1W2PNR3 127 aa24.09■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 CLDN1O95832 211 aa24.09■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 OR1Q1Q15612 314 aa24.09■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 NPTX1Q15818 432 aa24.09■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 ULK3Q6PHR2 472 aa24.09■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 LIX1LQ8IVB5 337 aa24.09■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 OR4D11Q8NGI4 311 aa24.09■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 PCDHAC1Q9H158 963 aa24.09■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 C1orf21Q9H246 121 aa24.09■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 TRAPPC4Q9Y296 219 aa24.09■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa24.09■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 A0A0B4J2E0 115 aa24.08■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 A0A1B0GX12 115 aa24.08■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 DNPH1O43598 174 aa24.08■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 AQP8O94778 261 aa24.08■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 PMS2P2O95744 297 aa24.08■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 TFPIP10646 304 aa24.08■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 OPRM1P35372 400 aa24.08■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 DIO1P49895 249 aa24.08■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SSU72-201ENST00000291386 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms