RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 NRMQ8IXM6 262 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2T33Q8NG76 320 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR151Q8TDV0 419 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 PRSS27Q9BQR3 290 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 CTPS2Q9NRF8 586 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 SURF4O15260 269 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 SNX4O95219 450 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 NSA2O95478 260 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
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CAPNS1-204ENST00000587718 GAAP10253 952 aa23.4■■□□□ 1.34
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CAPNS1-204ENST00000587718 SEPHS1P49903 392 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 WNT4P56705 351 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 TPBGQ13641 420 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM16LQ309B1 348 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 CARFQ8N187 725 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5T3Q8NGG3 340 aa23.4■■□□□ 1.34
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CAPNS1-204ENST00000587718 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
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CAPNS1-204ENST00000587718 TCTE1Q5JU00 501 aa23.4■■□□□ 1.34
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CAPNS1-204ENST00000587718 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa23.4■■□□□ 1.34
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CAPNS1-204ENST00000587718 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
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CAPNS1-204ENST00000587718 RNFT2Q96EX2 444 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ZDHHC12Q96GR4 267 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 CD180Q99467 661 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 COQ7Q99807 217 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM60AQ9NP50 221 aa23.4■■□□□ 1.34
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CAPNS1-204ENST00000587718 CLEC2DQ9UHP7 191 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 SSR3Q9UNL2 185 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa23.39■■□□□ 1.33
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CAPNS1-204ENST00000587718 RDH16O75452 317 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 GPX5O75715 221 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 MED26O95402 600 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 HBQ1P09105 142 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 RBM34P42696 430 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 ID2Q02363 134 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 ACSM1Q08AH1 577 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 IL11RAQ14626 422 aa23.39■■□□□ 1.33
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CAPNS1-204ENST00000587718 MAPK14Q16539 360 aa23.39■■□□□ 1.33
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CAPNS1-204ENST00000587718 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa23.38■■□□□ 1.33
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CAPNS1-204ENST00000587718 CLDN4O14493 209 aa23.38■■□□□ 1.33
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CAPNS1-204ENST00000587718 S1PR1P21453 382 aa23.38■■□□□ 1.33
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CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1CAP62136 330 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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CAPNS1-204ENST00000587718 DAPK2Q9UIK4 370 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 TENM4Q6N022 2769 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 CT62P0C5K7 136 aa23.37■■□□□ 1.33
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CAPNS1-204ENST00000587718 PSD4Q8NDX1 1056 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 OR52R1Q8NGF1 315 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 OR9A4Q8NGU2 314 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4Q3Q8NH05 313 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM255BQ8WV15 326 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC41A2Q96JW4 573 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM2Q9C040 744 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 SCN3AQ9NY46 2000 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 BSNQ9UPA5 3926 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 HTR3EA5X5Y0 456 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa23.36■■□□□ 1.33
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