RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 NR2F1P10589 423 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 ACVR1BP36896 505 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 ARHGDIBP52566 201 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 NHLRC1Q6VVB1 395 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 C17orf107Q6ZR85 190 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 MRGPREQ86SM8 312 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 CPOQ8IVL8 374 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 TM4SF18Q96CE8 201 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 ORAI1Q96D31 301 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 C20orf85Q9H1P6 137 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 OR10A4Q9H209 315 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 MMP17Q9ULZ9 603 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 A0A1W2PRG6 482 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 NDUFA2O43678 99 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 TMPRSS11DO60235 418 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 REM1O75628 298 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 PTHLHP12272 177 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 CFL1P23528 166 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 MTNR1BP49286 362 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 PLBD1Q6P4A8 553 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 TFAP2EQ6VUC0 442 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 Q6ZSR6 202 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 SLC9B2Q86UD5 537 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 MOSPD2Q8NHP6 518 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 PRRC1Q96M27 445 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 SLC38A2Q96QD8 506 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 ALG8Q9BVK2 526 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 ASB6Q9NWX5 421 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 PIPOXQ9P0Z9 390 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 TBC1D29Q9UFV1 150 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 ICKQ9UPZ9 632 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 CDC42EP2O14613 210 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 SEMA4FO95754 770 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 THY1P04216 161 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 ATF1P18846 271 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 OMPP47874 163 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 OR5M10Q6IEU7 315 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 PYHIN1Q6K0P9 492 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 FAM198BQ6UWH4 519 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 CEACAM19Q7Z692 300 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 VRK2Q86Y07 508 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 NRSN1Q8IZ57 195 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 RFLNBQ8N5W9 214 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 TSTD1Q8NFU3 115 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 OR11G2Q8NGC1 345 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 SLC5A11Q8WWX8 675 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 COX14Q96I36 57 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 ZNF607Q96SK3 696 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 ENKD1Q9H0I2 346 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 A0A1B0GVI7 797 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 CHST10O43529 356 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 TFP02787 698 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 SERPIND1P05546 499 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 RAD52P43351 418 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 TAS2R41P59536 307 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 DPTQ07507 201 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 NDUFA9Q16795 377 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 FCRLBQ6BAA4 426 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 C3P1Q6ZMU1 363 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 ADCK2Q7Z695 626 aa8.45□□□□□ -1.06
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THBS3-211ENST00000541990 OR52N1Q8NH53 320 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 ACOT12Q8WYK0 555 aa8.45□□□□□ -1.06
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THBS3-211ENST00000541990 SGTBQ96EQ0 304 aa8.45□□□□□ -1.06
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THBS3-211ENST00000541990 OR52A5Q9H2C5 316 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 LHX9Q9NQ69 397 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 TAC3Q9UHF0 121 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 GPR160Q9UJ42 338 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 NPTNQ9Y639 398 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 H7BY64 318 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 CBX7O95931 251 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 PLATP00750 562 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-211ENST00000541990 IGHV4-34P06331 123 aa8.44□□□□□ -1.06
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