RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534382.5

CTSB-231, Transcript of cathepsin B, human

TSL 4

Gene CTSB, Length 764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSB-231	ENST00000534382	ETS2	P15036	469 aa		13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	SLC7A1	P30825	629 aa		13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	SSTR2	P30874	369 aa		13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	CDK6	Q00534	326 aa		13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	EPS8	Q12929	822 aa		13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	GUSBP1	Q15486	140 aa		13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	REEP3	Q6NUK4	255 aa		13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	LUZP2	Q86TE4	346 aa		13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	C14orf79	Q96F83	325 aa		13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	GLRX2	Q9NS18	164 aa		13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		13	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382		A0A1W2PNR3	127 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	GKN3P	P0CG01	181 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	SLC6A2	P23975	617 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	HTR3A	P46098	478 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	RAC3	P60763	192 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	SIRPA	P78324	504 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	SCARB2	Q14108	478 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	MAPRE2	Q15555	327 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	ADRM1	Q16186	407 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	SYT14P1	Q58G82	188 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	VWA1	Q6PCB0	445 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	KIF18B	Q86Y91	864 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	OR5B2	Q96R09	309 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	SLC22A2	O15244	555 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	KRT34	O76011	436 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	CGA	P01215	116 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	SLC1A3	P43003	542 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	KIR2DL3	P43628	341 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	CPA2	P48052	419 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	CTBP2	P56545	445 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	MTPN	P58546	118 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	SORD	Q00796	357 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	RBBP4	Q09028	425 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	SELPLG	Q14242	412 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	MMEL1	Q495T6	779 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	COQ5	Q5HYK3	327 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF550	Q7Z398	422 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	KRT73	Q86Y46	540 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	HIPK4	Q8NE63	616 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	RNF128	Q8TEB7	428 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	ADAM19	Q9H013	955 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	GALNT8	Q9NY28	637 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	PRKD3	O94806	890 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	NPPA	P01160	153 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	TFPI	P10646	304 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	CD8B	P10966	210 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	TACR3	P29371	465 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	PRKAR1B	P31321	381 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	MAP2K6	P52564	334 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	SEC24C	P53992	1094 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	COPZ1	P61923	177 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	TLE4	Q04727	773 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	MYBPH	Q13203	477 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	CYP51A1	Q16850	503 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	REP15	Q6BDI9	236 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CTSB-231	ENST00000534382	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		12.97	□□□□□ -0.33

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