RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517215.1

RNU6-1238P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1238, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1238P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC22A25Q6T423 547 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CFAP77Q6ZQR2 320 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SCYL3Q8IZE3 742 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TCAIMQ8N3R3 496 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FRMD1Q8N878 549 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CCDC54Q8NEL0 328 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC30A7Q8NEW0 376 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OR13C5Q8NGS8 318 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FBXO25Q8TCJ0 367 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ACTRT1Q8TDG2 376 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FGF14Q92915 247 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC35C1Q96A29 364 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HOOK2Q96ED9 719 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RAB40CQ96S21 281 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MAP7D2Q96T17 732 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CCM2Q9BSQ5 444 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TBCDQ9BTW9 1192 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GPR174Q9BXC1 333 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC2A11Q9BYW1 496 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 REG4Q9BYZ8 158 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC19A3Q9BZV2 496 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 C1orf198Q9H425 327 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 VIPAS39Q9H9C1 493 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SCPEP1Q9HB40 452 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF302Q9NR11 478 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TBC1D22BQ9NU19 505 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 EHFQ9NZC4 300 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 KCND2Q9NZV8 630 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 STK26Q9P289 416 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CTSFQ9UBX1 484 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 JPT1Q9UK76 154 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RNF150Q9ULK6 438 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PADI2Q9Y2J8 665 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ATRQ13535 2644 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 AKAP13Q12802 2813 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 USP6P35125 1406 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 A0A0G2JQZ4 141 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 A0A1W2PR77 199 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TTC26A0AVF1 554 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF726A6NNF4 738 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 YJEFN3A6XGL0 299 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GGTLC3B5MD39 225 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 E5RGE8 158 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 E9PBE3 544 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 C11orf98E9PRG8 122 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 KIAA0513O60268 411 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SELENOFO60613 162 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TBX10O75333 385 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RFPL1O75677 317 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RP2O75695 350 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PDE5AO76074 875 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GSRP00390 522 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ALPPL2P10696 532 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PRPS2P11908 318 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LAMP2P13473 410 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF708P17019 499 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TMEM11P17152 192 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SDC1P18827 310 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SPRR2EP22531 72 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 MAGEA5P43359 124 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GPR4P46093 362 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OR1G1P47890 313 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NPBWR2P48146 333 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TDO2P48775 406 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NEK2P51955 445 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CDH4P55283 916 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NEXNQ0ZGT2 675 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TRIM14Q14142 442 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RBBP7Q16576 425 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ADPRMQ3LIE5 342 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC39A12Q504Y0 691 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 KLHL12Q53G59 568 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PDZD11Q5EBL8 140 aa-1.3□□□□□ -2.62
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