RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 H3BMH7 237 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GH1P01241 217 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KCNJ1P48048 391 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAD23AP54725 363 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZP4Q12836 540 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BOLA3Q53S33 107 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TEX19Q8NA77 164 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EPSTI1Q96J88 318 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FCRL1Q96LA6 429 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PANX3Q96QZ0 392 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DNTTIP1Q9H147 329 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZFP14Q9HCL3 533 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PFDN4Q9NQP4 134 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KLHL28Q9NXS3 571 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LTBP2Q14767 1821 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GMNNO75496 209 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCNE2O96020 404 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BCKDHAP12694 445 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GNPDA1P46926 289 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRRX1P54821 245 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC5A12Q1EHB4 618 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LIPNQ5VXI9 398 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NKAIN2Q5VXU1 208 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR8G2PQ6IF36 304 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C11orf71Q6IPW1 123 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BRINP3Q76B58 766 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 VSIG1Q86XK7 387 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF680Q8NEM1 530 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FANK1Q8TC84 345 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BRSK1Q8TDC3 778 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TM4SF19Q96DZ7 209 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HIST1H4GQ99525 98 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PARP11Q9NR21 331 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCYOX1Q9UHG3 505 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NARFQ9UHQ1 456 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TPST2O60704 377 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF250P15622 560 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SERPINA2P20848 420 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KLK7P49862 253 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GDI2P50395 445 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DLX1P56177 255 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPBP1Q86WP2 473 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC54Q8NEL0 328 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NEK11Q8NG66 645 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR10G4Q8NGN3 311 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CD300LFQ8TDQ1 290 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AP2M1Q96CW1 435 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC51Q96ER9 411 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DEFB118Q96PH6 123 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CYP2S1Q96SQ9 504 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CITED1Q99966 193 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLF1Q9BQI6 1058 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CLMPQ9H6B4 373 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAGEF1Q9HAY2 307 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SGK2Q9HBY8 427 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TUFT1Q9NNX1 390 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GHRLQ9UBU3 117 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIP11Q15643 1979 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ICE1Q9Y2F5 2266 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PEX7O00628 323 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 XKRYO14609 159 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF562Q6V9R5 426 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NHLRC2Q8NBF2 726 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NEURL3Q96EH8 262 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MS4A14Q96JA4 679 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPATA16Q9BXB7 569 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SELENOIQ9C0D9 397 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TM9SF3Q9HD45 589 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MED13Q9UHV7 2174 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANKRD12Q6UB98 2062 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARHGEF37A1IGU5 675 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 INS-IGF2F8WCM5 200 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 H7C0S8 307 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAD51BO15315 384 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADAM12O43184 909 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANGP03950 147 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC35G4P0C7Q5 338 aa-0.36□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms