RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	HDX	Q7Z353	690 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	C10orf111	Q8N326	155 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITCH	Q96J02	903 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARL5B	Q96KC2	179 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	FOXC2	Q99958	501 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSD2	Q9BQI7	771 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	BCO1	Q9HAY6	547 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYTIP	O60759	359 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUDT7	P0C024	238 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	NR2F1	P10589	423 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	BMP2	P12643	396 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	RYK	P34925	604 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	DIO1	P49895	249 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	AQP5	P55064	265 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYT14P1	Q58G82	188 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRINA	Q7Z429	371 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	VRK2	Q86Y07	508 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	CMIP	Q8IY22	773 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM234	Q8WY98	164 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	MBD6	Q96DN6	1003 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR5B2	Q96R09	309 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	C12orf49	Q9H741	205 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	RMND5A	Q9H871	391 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	GP6	Q9HCN6	339 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	RLIM	Q9NVW2	624 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACAN	P16112	2415 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A096LPI6	279 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDHR4	A6H8M9	788 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAAH	O00519	579 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLF4	O43474	513 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRKD3	O94806	890 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	BCHE	P06276	602 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC7A1	P30825	629 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	NTF4	P34130	210 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	CRAT	P43155	626 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNJ5	P48544	419 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	DSTN	P60981	165 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	HPCA	P84074	193 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPS8	Q12929	822 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	RGN	Q15493	299 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC43A2	Q8N370	569 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF563	Q8TA94	476 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	STON2	Q8WXE9	905 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	PMM1	Q92871	262 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM19	Q96HH6	336 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAGEB18	Q96M61	343 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	MED18	Q9BUE0	208 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM72	A0PK05	275 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF716	A6NP11	495 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLIC1	O00299	241 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAMP1	O60894	148 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANP32D	O95626	131 aa		11.28	□□□□□ -0.6

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