RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
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SH3BP2-209ENST00000504450 MMP27Q9H306 513 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF167Q9H6Y7 350 aa9.89□□□□□ -0.83
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SH3BP2-209ENST00000504450 CMC2Q9NRP2 79 aa9.89□□□□□ -0.83
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SH3BP2-209ENST00000504450 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 CTSFQ9UBX1 484 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
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