RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	DRD5	P21918	477 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	FPR3	P25089	353 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	ACVR2A	P27037	513 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	HTR2A	P28223	471 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	OMP	P47874	163 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	CDK5	Q00535	292 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	GINS1	Q14691	196 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	OR1Q1	Q15612	314 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF141	Q15928	474 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	KIF18B	Q86Y91	864 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	FCGR1B	Q92637	280 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC35B4	Q969S0	331 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	NUDT9	Q9BW91	350 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	ITPA	Q9BY32	194 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	SPTA1	P02549	2419 aa		13.4	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	DYRK3	O43781	588 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	LYPD3	O95274	346 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	CYC1	P08574	325 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	GKN3P	P0CG01	181 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	CT45A8	P0DMV1	189 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	CT45A9	P0DMV2	189 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	GIPR	P48546	466 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	NUDT6	P53370	316 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	CBLC	Q9ULV8	474 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1W2PQ72	361 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	KLF4	O43474	513 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ATE1	O95260	518 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	PDGFA	P04085	211 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	RFX3	P48380	749 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	SMS	P52788	366 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ATP12A	P54707	1039 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	PLAUR	Q03405	335 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	OCLN	Q16625	522 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	BTBD16	Q32M84	506 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF613	Q6PF04	617 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	NRM	Q8IXM6	262 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	CMIP	Q8IY22	773 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	STX19	Q8N4C7	294 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	BCORP1	Q8N888	145 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	LPAR4	Q99677	370 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	AMBN	Q9NP70	447 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	GPR83	Q9NYM4	423 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	CFL2	Q9Y281	166 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ENTPD6	O75354	484 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	NTN1	O95631	604 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC15A1	P46059	708 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	PCYT1A	P49585	367 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	FGFBP1	Q14512	234 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	IRF3	Q14653	427 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TMEM18-208	ENST00000497508	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		13.38	□□□□□ -0.27

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