RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 PAX7P23759 505 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 FPR2P25090 351 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 MPGP29372 298 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 MAGEA8P43361 318 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 SERPINB8P50452 374 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 UBA52P62987 128 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 IL13RA1P78552 427 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 BTKQ06187 659 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 C2orf54Q08AI8 447 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 RIN1Q13671 783 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 CBFBQ13951 182 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 PDK3Q15120 406 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 QPRTQ15274 297 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 RASA2Q15283 850 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 TRADDQ15628 312 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 ADIPOQQ15848 244 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 ADRM1Q16186 407 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 IMPG1Q17R60 797 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 TECRLQ5HYJ1 363 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 ZNF311Q5JNZ3 666 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 SPDYAQ5MJ70 313 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 LRIG3Q6UXM1 1119 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 TMPPEQ6ZT21 453 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 CYS1Q717R9 158 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 SPATA21Q7Z572 469 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 WDR31Q8NA23 367 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 NUP43Q8NFH3 380 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 OR52E4Q8NGH9 312 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 CLDND2Q8NHS1 167 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 NANPQ8TBE9 248 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 APIPQ96GX9 242 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 ARL5BQ96KC2 179 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 ANKRD27Q96NW4 1050 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 MS4A4EQ96PG1 132 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 SLC38A2Q96QD8 506 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 SLC6A7Q99884 636 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 ACPTQ9BZG2 426 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 HOXD1Q9GZZ0 328 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 OBP2BQ9NPH6 170 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 PARPBPQ9NWS1 579 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 ARMCX1Q9P291 453 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 PPIAL4AQ9Y536 164 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 CORINQ9Y5Q5 1042 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 ACTL7BQ9Y614 415 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 VWFP04275 2813 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.35□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 WNK2Q9Y3S1 2297 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 A0A0G2JMP0 313 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 A0A0X1KG70 313 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 FAM187AA6NFU0 413 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 POM121CA8CG34 1229 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 KLF11O14901 512 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 CYP7B1O75881 506 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 RPS17P08708 135 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 GAAP10253 952 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 ACP2P11117 423 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 UBL4AP11441 157 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 CHN1P15882 459 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 TSPAN8P19075 237 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 NPR2P20594 1047 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 CDH13P55290 713 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 RAE1P78406 368 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 SLC25A3Q00325 362 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 MYBPC1Q00872 1141 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 MERTKQ12866 999 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 TIGD2Q4W5G0 525 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 SYT14P1Q58G82 188 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 CCNJQ5T5M9 372 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 REP15Q6BDI9 236 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 CBLN3Q6UW01 205 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 C1QL2Q7Z5L3 287 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 ZAR1Q86SH2 424 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 SLC16A11Q8NCK7 471 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 MNS1Q8NEH6 495 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 OR4M2Q8NGB6 313 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 OR5W2Q8NH69 310 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 METTL6Q8TCB7 284 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 GPR119Q8TDV5 335 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 CKAP2Q8WWK9 683 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 TMEM234Q8WY98 164 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 ST8SIA1Q92185 356 aa5.34□□□□□ -1.55
CBX1-205ENST00000495350 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms