RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 TRAV27A0A087WT01 109 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF879B4DU55 563 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ICOSLGO75144 302 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 OPN1LWP04000 364 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CYC1P08574 325 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 S1PR1P21453 382 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 F8A1P23610 371 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 GALNSP34059 522 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 OMPP47874 163 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ERVK-25P63136 954 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 FOXK1P85037 733 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 GLO1Q04760 184 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SHFQ7M4L6 423 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CPOQ8IVL8 374 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF283Q8N7M2 679 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TEX19Q8NA77 164 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 APMAPQ9HDC9 416 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PTPRDP23468 1912 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MT-ATP6P00846 226 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SERPINA7P05543 415 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ITGAMP11215 1152 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 APOFQ13790 326 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PGGHGQ32M88 737 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 NDUFAF6Q330K2 333 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ST8SIA1Q92185 356 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 FCRL1Q96LA6 429 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 C10orf90Q96M02 699 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PARPBPQ9NWS1 579 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 FBXL4Q9UKA2 621 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TCFL5Q9UL49 500 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 GPR52Q9Y2T5 361 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 NLRC5Q86WI3 1866 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 DOCK4Q8N1I0 1966 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1B0GVI7 797 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ASPDHA6ND91 283 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CYR61O00622 381 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TBX1O43435 398 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ALPLP05186 524 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CCNOP22674 350 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 GSTT1P30711 240 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CSNK1A1P48729 337 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SELENOVP59797 346 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 GABARAPL2P60520 117 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TGFBR3Q03167 851 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM16LQ309B1 348 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 FAM69AQ5T7M9 428 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 C3orf33Q6P1S2 294 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SLC43A2Q8N370 569 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CT55Q8WUE5 264 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 KCTD7Q96MP8 289 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF350Q9GZX5 532 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 VGLL3A8MV65 326 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SLC1A7O00341 560 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PRODHO43272 600 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 FOXS1O43638 330 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 IGHG1P01857 330 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 FPR3P25089 353 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SLC3A1Q07837 685 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SLC6A19Q695T7 634 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SLC18B1Q6NT16 456 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF367Q7RTV3 350 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CALHM3Q86XJ0 350 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 CYB561A3Q8NBI2 242 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 FNDC8Q8TC99 324 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 S100ZQ8WXG8 99 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SLC38A1Q9H2H9 487 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 GPATCH2Q9NW75 528 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 C2orf72A6NCS6 295 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 GASTP01350 101 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 HLCSP50747 726 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TUBA3CQ13748 450 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TMPPEQ6ZT21 453 aa7.61□□□□□ -1.19
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